More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4626 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  34.33 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.67 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 
226 aa  104  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  32.24 
 
 
227 aa  98.2  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  33.5 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.9 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
218 aa  94.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.81 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  31.22 
 
 
214 aa  92.8  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  30 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  33.17 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.87 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  34.1 
 
 
234 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  26.89 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  36.13 
 
 
227 aa  88.2  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  30.63 
 
 
243 aa  88.2  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 
216 aa  88.2  9e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.95 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  31.86 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 
227 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
229 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  28.11 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  29 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.85 
 
 
221 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.12 
 
 
236 aa  85.9  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  34.67 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  32.49 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 
461 aa  85.5  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  32.35 
 
 
233 aa  85.9  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.57 
 
 
222 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  30.58 
 
 
233 aa  85.5  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  26.39 
 
 
225 aa  85.5  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 
234 aa  85.1  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  29.77 
 
 
233 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  32.28 
 
 
225 aa  85.1  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  26.87 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  28.34 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  27.45 
 
 
227 aa  84  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  29.08 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  27.86 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
224 aa  84  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.65 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  28.11 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.5 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  28.36 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  29.06 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.83 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.21 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.9 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  32.49 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  28.79 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  26.36 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  30.65 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  24.64 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  27.09 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  24.64 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  27.55 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.26 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.86 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  27.94 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.86 
 
 
225 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  27.94 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.53 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.86 
 
 
225 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
232 aa  81.3  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.17 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  27.86 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  29.59 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  29.85 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.51 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.21 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  30.92 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  30.1 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  28.1 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.16 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  32.02 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.91 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  30.63 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.87 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>