More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0626 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 252 aa  523  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  62.6 
 
 		 255 aa  330  2e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  50.59 
 
 		 256 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  49.2 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  45.34 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  45.34 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  42 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  42.4 
 
 		 248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  44.08 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  43.72 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  44.22 
 
 		 247 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  41.77 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  43.02 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  41.77 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  41.37 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  40.48 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  39.52 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  40.56 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  38.25 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  37.25 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  39.04 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  39.52 
 
 		 244 aa  168  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  36.4 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  37.2 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  37.2 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  37.2 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  37.2 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  37.2 
 
 		 245 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  37.5 
 
 		 260 aa  165  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  35.74 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  36.55 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  35.89 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  38.58 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  37.2 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  40.64 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  37.2 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  36.69 
 
 		 245 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  34.68 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  42 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  35.74 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  34.68 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  39 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  39.76 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  34.84 
 
 		 264 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 		 244 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  36.21 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  36.29 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  39 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  34.68 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  34.4 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 		 267 aa  154  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 		 267 aa  154  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1444  tRNA pseudouridine synthase A  36.15 
 
 		 257 aa  154  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  36.48 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  34.92 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  37.76 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  38.59 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  38.59 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  34.14 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  39.83 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  37.86 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4191  tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  35.48 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  35.08 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1560  tRNA pseudouridine synthase A  35.89 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.949883  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  38.59 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  35.48 
 
 		 271 aa  151  8e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  34.68 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  38.59 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  36.69 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  33.87 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0879  tRNA pseudouridine synthase A  36.4 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  36.69 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  38.59 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  34.94 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2073  tRNA pseudouridine synthase A  33.67 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23840  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0966  tRNA pseudouridine synthase A  34.51 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.982634  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  35.2 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  35.74 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2612  tRNA pseudouridine synthase A  36.44 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  35.34 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3044  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>