More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2246 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
427 aa  857    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  68.06 
 
 
432 aa  623  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  27.57 
 
 
420 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  29.13 
 
 
414 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  28.15 
 
 
429 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  27.16 
 
 
400 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
415 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  24.94 
 
 
411 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  25.24 
 
 
406 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  24.94 
 
 
411 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  25.18 
 
 
399 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
414 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  25.2 
 
 
410 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  24.88 
 
 
400 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  27.03 
 
 
405 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  24.17 
 
 
405 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 
423 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  27.6 
 
 
426 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  26.4 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  26.4 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  29.65 
 
 
428 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  28.76 
 
 
428 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  28.76 
 
 
428 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 
451 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  28.76 
 
 
428 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
423 aa  86.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  28.76 
 
 
428 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  25.26 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.39 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  28.11 
 
 
432 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 
431 aa  84  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  22.96 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
432 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  27.82 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  27.75 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  22.73 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  28.42 
 
 
433 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  24.43 
 
 
473 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.31 
 
 
428 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  21.19 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  28.11 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.42 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  24.49 
 
 
459 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  27.03 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  23.08 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.42 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.42 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  25.6 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  28.07 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  25.1 
 
 
431 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
430 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.07 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  25.78 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  23.32 
 
 
478 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  23.32 
 
 
478 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  26.98 
 
 
432 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  24.52 
 
 
478 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  24.52 
 
 
478 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  25.99 
 
 
393 aa  77  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  24.52 
 
 
478 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  24.52 
 
 
478 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  24.52 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  24.25 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  24.25 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  23.27 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  24.56 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.23 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  28.5 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  31.22 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.71 
 
 
440 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.71 
 
 
440 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.72 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  27.72 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.81 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  24.63 
 
 
469 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  20.92 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  23.65 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  25.94 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43351  MFS family transporter: sugar  27.27 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  24.38 
 
 
464 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  27.27 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  22.99 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  22.73 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  24.18 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  28.26 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  24.35 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  24 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>