84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1372 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 193 aa  373  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  39.68 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  38.65 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  65.96 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  56.67 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  61.54 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0348  hypothetical protein  32.08 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  29.61 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  27.46 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  52.08 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  46.75 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3625  putative transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.679664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 248 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  33.73 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  56.82 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 238 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  30.99 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 234 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.66 
 
 		 236 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.66 
 
 		 236 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  31.65 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 477 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  36.92 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 477 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  29.23 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  40 
 
 		 237 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  35.53 
 
 		 241 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 198 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 198 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 228 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  26.34 
 
 		 197 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 195 aa  41.2  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  24.6 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>