More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1477 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
198 aa  408  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  48.92 
 
 
188 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  48.92 
 
 
188 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  48.92 
 
 
188 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  48.92 
 
 
188 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  48.92 
 
 
188 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  50.55 
 
 
190 aa  180  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  47.34 
 
 
190 aa  176  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  48.39 
 
 
188 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  48.39 
 
 
188 aa  174  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  48.39 
 
 
188 aa  174  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  48.39 
 
 
188 aa  174  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  48.39 
 
 
188 aa  174  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  48.39 
 
 
188 aa  174  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  48.65 
 
 
188 aa  174  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  48.39 
 
 
188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  45.95 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  45.95 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  47.85 
 
 
188 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  45.96 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  45.21 
 
 
192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  45.96 
 
 
199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  46.49 
 
 
199 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  45.6 
 
 
200 aa  151  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  46.96 
 
 
193 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  41.34 
 
 
200 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  41.34 
 
 
195 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  42.31 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  41.9 
 
 
195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  40.93 
 
 
190 aa  138  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  43.65 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  42.54 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  42.54 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  42.54 
 
 
187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  42.63 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 
187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  41.01 
 
 
189 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  41.44 
 
 
187 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  42.22 
 
 
187 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  40.44 
 
 
188 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  41.76 
 
 
187 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  40.33 
 
 
187 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  38.33 
 
 
191 aa  121  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  36.93 
 
 
166 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
185 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  32.26 
 
 
389 aa  71.2  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  28.5 
 
 
291 aa  71.2  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  27.18 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  46.43 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  36.14 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  35.14 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  35.57 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  44.58 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  30.1 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  34 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  43.75 
 
 
226 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  39.36 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  28.17 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  27.01 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  31.98 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  30.53 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  43.75 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  36.89 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  27.32 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  36.89 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  35.04 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  27.32 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  36.89 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  27.32 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  31.98 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  27.44 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  36.89 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  36.89 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  40.96 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  32.45 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>