More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3680 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  100 
 
 
319 aa  632  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  92.18 
 
 
309 aa  568  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  85.67 
 
 
310 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  85.67 
 
 
310 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  85.34 
 
 
310 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  81.29 
 
 
313 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  70.82 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  64.72 
 
 
312 aa  387  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.91 
 
 
308 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  63.79 
 
 
310 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  61.97 
 
 
308 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  62.12 
 
 
388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  61.86 
 
 
374 aa  353  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  61.56 
 
 
302 aa  346  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  59.22 
 
 
308 aa  341  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  60.06 
 
 
308 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  53.53 
 
 
314 aa  328  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  58.94 
 
 
313 aa  322  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  58.72 
 
 
309 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.25 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  53.99 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  53.14 
 
 
334 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  50.32 
 
 
329 aa  258  9e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  48.59 
 
 
299 aa  256  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  44.92 
 
 
311 aa  248  9e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  47.8 
 
 
319 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  45.24 
 
 
300 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  45.54 
 
 
306 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  45.58 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  43.96 
 
 
322 aa  222  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  43.03 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  41.58 
 
 
303 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
302 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  44.63 
 
 
322 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  41.64 
 
 
301 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
299 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  47.6 
 
 
282 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.56 
 
 
331 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  37.7 
 
 
304 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  40.8 
 
 
290 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  42.67 
 
 
314 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  42.37 
 
 
330 aa  198  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.29 
 
 
301 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  49.3 
 
 
301 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  36.98 
 
 
305 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  41.14 
 
 
314 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  41.36 
 
 
280 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.37 
 
 
283 aa  193  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  43.45 
 
 
331 aa  192  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  36.96 
 
 
319 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  41.92 
 
 
305 aa  192  9e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  48.37 
 
 
284 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  36.58 
 
 
305 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  45.61 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  51.14 
 
 
297 aa  189  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  40.79 
 
 
330 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
305 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 
305 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  36.24 
 
 
301 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.13 
 
 
347 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  41.33 
 
 
319 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
317 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  47.35 
 
 
324 aa  186  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  42.28 
 
 
301 aa  185  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  35.56 
 
 
308 aa  185  8e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  45.53 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  47.87 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  40.4 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  39.23 
 
 
322 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.24 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  41.02 
 
 
333 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  39.74 
 
 
285 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.61 
 
 
310 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.02 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
302 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 
353 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  47.66 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  38.56 
 
 
741 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  39.72 
 
 
254 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
300 aa  178  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  39.34 
 
 
310 aa  178  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  39.31 
 
 
319 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  39.41 
 
 
311 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.29 
 
 
313 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  42.56 
 
 
312 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  36.16 
 
 
295 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  39.33 
 
 
276 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  37.54 
 
 
326 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.02 
 
 
321 aa  176  7e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.89 
 
 
286 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  47.14 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  36.88 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  38.25 
 
 
256 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  37.7 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  36.61 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  39.15 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  47.03 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  39.18 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>