More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0091 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
1265 aa  2573    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65 
 
 
747 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65 
 
 
746 aa  496  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.56 
 
 
747 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.47 
 
 
751 aa  491  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.22 
 
 
707 aa  453  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.28 
 
 
707 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.72 
 
 
707 aa  436  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  44.35 
 
 
723 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  41.01 
 
 
799 aa  283  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.23 
 
 
791 aa  279  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  42.58 
 
 
760 aa  277  8e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  41.46 
 
 
729 aa  271  8e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  37.65 
 
 
824 aa  267  8e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  39.39 
 
 
693 aa  266  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  40.68 
 
 
712 aa  266  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  37.73 
 
 
808 aa  266  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.85 
 
 
756 aa  266  3e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.09 
 
 
799 aa  262  4e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  41.35 
 
 
726 aa  258  6e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  37.35 
 
 
727 aa  255  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.32 
 
 
694 aa  249  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.11 
 
 
739 aa  247  9.999999999999999e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.67 
 
 
706 aa  244  1e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.81 
 
 
662 aa  240  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.38 
 
 
715 aa  231  7e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.86 
 
 
709 aa  229  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.47 
 
 
708 aa  229  3e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.98 
 
 
710 aa  226  2e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.02 
 
 
729 aa  224  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.91 
 
 
700 aa  219  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.89 
 
 
988 aa  203  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  27.53 
 
 
874 aa  152  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.83 
 
 
785 aa  151  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.81 
 
 
803 aa  146  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.88 
 
 
811 aa  145  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.64 
 
 
780 aa  145  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.8 
 
 
811 aa  145  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.73 
 
 
807 aa  145  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.17 
 
 
800 aa  141  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.88 
 
 
810 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.54 
 
 
811 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  29.54 
 
 
1060 aa  137  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  29.64 
 
 
825 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.35 
 
 
1004 aa  134  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  29.33 
 
 
1385 aa  133  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.86 
 
 
1318 aa  133  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.05 
 
 
825 aa  133  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.36 
 
 
816 aa  133  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  28.53 
 
 
904 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.1 
 
 
1004 aa  132  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.43 
 
 
1230 aa  129  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  28.34 
 
 
918 aa  127  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  27.79 
 
 
2015 aa  125  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  26.77 
 
 
901 aa  125  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.51 
 
 
951 aa  124  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.79 
 
 
996 aa  124  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  27.9 
 
 
909 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 
727 aa  121  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  27.05 
 
 
2152 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  27.72 
 
 
1767 aa  119  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  26.65 
 
 
916 aa  117  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  27.92 
 
 
2208 aa  117  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.45 
 
 
688 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.83 
 
 
922 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  33.9 
 
 
903 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  25.17 
 
 
1465 aa  116  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  27.1 
 
 
935 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.58 
 
 
918 aa  115  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.57 
 
 
762 aa  115  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.58 
 
 
918 aa  115  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.58 
 
 
918 aa  115  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  26.94 
 
 
936 aa  115  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  26.46 
 
 
906 aa  114  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.85 
 
 
952 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.12 
 
 
917 aa  114  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  28.81 
 
 
919 aa  114  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  27.98 
 
 
905 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  27.56 
 
 
1055 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.22 
 
 
820 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  26.46 
 
 
1165 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  27.56 
 
 
2111 aa  113  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  29.16 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.65 
 
 
667 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  29.12 
 
 
906 aa  113  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  27.72 
 
 
1942 aa  112  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.24 
 
 
684 aa  111  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.03 
 
 
699 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  25.27 
 
 
952 aa  110  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.62 
 
 
697 aa  109  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  30.39 
 
 
893 aa  109  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  25.07 
 
 
1770 aa  108  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  31.11 
 
 
890 aa  108  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
695 aa  108  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  24.81 
 
 
946 aa  108  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  30.08 
 
 
889 aa  108  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  25.66 
 
 
1589 aa  108  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.99 
 
 
933 aa  108  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  26.8 
 
 
877 aa  108  8e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  27.73 
 
 
924 aa  107  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>