More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0010 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  58.02 
 
 
211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  47.09 
 
 
217 aa  188  5.999999999999999e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.43 
 
 
216 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.14 
 
 
210 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  45.41 
 
 
211 aa  176  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  42.65 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  42.5 
 
 
211 aa  168  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  43.01 
 
 
213 aa  167  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  39.51 
 
 
215 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  45.77 
 
 
209 aa  167  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  42.16 
 
 
203 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.49 
 
 
206 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  39.79 
 
 
217 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  42.44 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  40.69 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  39.71 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  40.2 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  41.35 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  38.54 
 
 
213 aa  162  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  39.02 
 
 
219 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  41.71 
 
 
203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  41.67 
 
 
205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  39.22 
 
 
208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  41.67 
 
 
205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  39.22 
 
 
208 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  39.22 
 
 
208 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  39.22 
 
 
208 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  39.22 
 
 
208 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  39.22 
 
 
208 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  37.02 
 
 
213 aa  161  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  39.22 
 
 
208 aa  161  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  37.75 
 
 
232 aa  161  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  40.21 
 
 
219 aa  161  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  39.22 
 
 
208 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  36.92 
 
 
217 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  38.5 
 
 
212 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  40.62 
 
 
210 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  41.95 
 
 
212 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  43.2 
 
 
213 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  42.5 
 
 
199 aa  159  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  43.75 
 
 
205 aa  158  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  38.65 
 
 
207 aa  158  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  40.1 
 
 
230 aa  158  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  40.1 
 
 
210 aa  158  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  42.21 
 
 
223 aa  158  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  42.21 
 
 
223 aa  158  7e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  40.21 
 
 
221 aa  157  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  39 
 
 
219 aa  157  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  42.11 
 
 
216 aa  156  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  40.89 
 
 
200 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  37.11 
 
 
226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.71 
 
 
216 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  37.32 
 
 
212 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  38.35 
 
 
208 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  38.19 
 
 
211 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  38.35 
 
 
215 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  35.64 
 
 
225 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  37.07 
 
 
214 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  37.62 
 
 
218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  38.66 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  36.49 
 
 
213 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  37.68 
 
 
207 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  34.45 
 
 
215 aa  151  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  37.19 
 
 
214 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  38.86 
 
 
240 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  32.24 
 
 
221 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  38.02 
 
 
210 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  38.5 
 
 
204 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  36.54 
 
 
210 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  35.1 
 
 
211 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  40.49 
 
 
217 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  37.44 
 
 
207 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  42.56 
 
 
225 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  42.56 
 
 
225 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  39.9 
 
 
207 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  38.22 
 
 
222 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  34.33 
 
 
234 aa  148  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  36.84 
 
 
226 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  34.93 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  37.44 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  35.71 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  37.56 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  35.38 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  34.63 
 
 
281 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  33.18 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  36.36 
 
 
210 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  37.25 
 
 
686 aa  146  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  36.67 
 
 
226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  40.49 
 
 
203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  38.24 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  36.23 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  36.71 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  34.91 
 
 
217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  33.83 
 
 
226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  36.08 
 
 
244 aa  144  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  36.97 
 
 
229 aa  144  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  36.06 
 
 
210 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  37.5 
 
 
901 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  37.38 
 
 
204 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>