More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03202 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  100 
 
 		 292 aa  611  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  33.2 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  30.47 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  33.48 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  30.08 
 
 		 402 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  34.35 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  31.44 
 
 		 428 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  28.32 
 
 		 341 aa  99  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  28.52 
 
 		 430 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  28.52 
 
 		 446 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  28.52 
 
 		 446 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  29.72 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  36.61 
 
 		 386 aa  96.3  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  30.08 
 
 		 411 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  31.88 
 
 		 471 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  29.09 
 
 		 428 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  30.68 
 
 		 398 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  30.77 
 
 		 433 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  30.68 
 
 		 431 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  28.68 
 
 		 412 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  30.68 
 
 		 426 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  32.05 
 
 		 356 aa  92.4  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.31 
 
 		 392 aa  91.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  34.74 
 
 		 435 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  28.34 
 
 		 411 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  28.34 
 
 		 411 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  28.34 
 
 		 411 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 392 aa  89  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  32.28 
 
 		 414 aa  89  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  28.57 
 
 		 381 aa  86.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  28.07 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  28.21 
 
 		 391 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  29.34 
 
 		 412 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  27.4 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  30.74 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  28.11 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  26.91 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  32.02 
 
 		 401 aa  82.4  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.82 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  28.82 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  26.12 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.63 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  24.83 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  26.12 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  28.63 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  28.8 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.67 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  27.62 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.51 
 
 		 390 aa  79  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  28.81 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  26.44 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  26.96 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  26.02 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1932  integrase/recombinase, phage associated  24.19 
 
 		 379 aa  75.5  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.706433  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  30.95 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.78 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  28.79 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.76 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0572  integrase  23.57 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000288735  normal  0.557029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0634  integrase  23.57 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000314832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  29.1 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  22.93 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  24.23 
 
 		 404 aa  72.4  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  25.6 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  33.14 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  30.41 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  25.19 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.35 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  21.22 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  27.42 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.91 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  26.25 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  27.24 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  29.05 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  25.64 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.95 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  22.81 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.19 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.19 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  25.1 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  27.04 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  25.48 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  26.04 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  28.11 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  32.19 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  27.48 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  27.31 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  25 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  31.41 
 
 		 417 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  25.76 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  24.09 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  25.74 
 
 		 452 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.47 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  26.64 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  29.05 
 
 		 451 aa  66.2  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  22.49 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  26.83 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.1 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>