90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0910 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  47.56 
 
 
726 aa  691    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  46.71 
 
 
733 aa  678    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  48.83 
 
 
729 aa  702    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  47.72 
 
 
739 aa  700    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  100 
 
 
729 aa  1514    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  51.31 
 
 
729 aa  769    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  46.57 
 
 
734 aa  672    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  46.47 
 
 
730 aa  671    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  66.26 
 
 
729 aa  1027    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  61.15 
 
 
740 aa  947    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  44.66 
 
 
729 aa  623  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  44.43 
 
 
734 aa  598  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  43.15 
 
 
722 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  43.89 
 
 
743 aa  545  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  39.35 
 
 
818 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  38.15 
 
 
750 aa  477  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  39.4 
 
 
774 aa  472  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  37.09 
 
 
726 aa  467  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  31.81 
 
 
699 aa  392  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  34.22 
 
 
730 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  35.16 
 
 
733 aa  345  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  31.74 
 
 
726 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  30.82 
 
 
713 aa  341  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  31.35 
 
 
727 aa  333  7.000000000000001e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.56 
 
 
718 aa  324  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  33.45 
 
 
716 aa  322  9.999999999999999e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  32.91 
 
 
701 aa  320  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.51 
 
 
707 aa  313  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  31.46 
 
 
728 aa  309  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.39 
 
 
699 aa  307  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  33.27 
 
 
736 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  33.27 
 
 
723 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  31.81 
 
 
708 aa  302  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  31.81 
 
 
708 aa  301  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  31.81 
 
 
708 aa  301  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  32.8 
 
 
709 aa  299  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  32.07 
 
 
709 aa  298  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  30.88 
 
 
730 aa  291  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  35.14 
 
 
701 aa  290  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  32.65 
 
 
723 aa  290  7e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  31.62 
 
 
708 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  32.94 
 
 
727 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  31.62 
 
 
708 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  32.37 
 
 
715 aa  287  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  30.88 
 
 
714 aa  282  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  29.36 
 
 
724 aa  280  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  30.38 
 
 
714 aa  279  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.5 
 
 
688 aa  278  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  33.2 
 
 
726 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.69 
 
 
700 aa  274  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  30.9 
 
 
740 aa  273  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  33.52 
 
 
722 aa  273  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  31.14 
 
 
707 aa  270  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  31.52 
 
 
721 aa  270  7e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  30.68 
 
 
747 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.03 
 
 
735 aa  265  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.85 
 
 
719 aa  264  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  30.97 
 
 
724 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  31.31 
 
 
733 aa  256  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  30.43 
 
 
718 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  29.62 
 
 
713 aa  251  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  32.3 
 
 
768 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  29.05 
 
 
704 aa  243  9e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  30.34 
 
 
747 aa  238  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.33 
 
 
683 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  25.8 
 
 
684 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  25.23 
 
 
657 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  25.3 
 
 
530 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  24.25 
 
 
732 aa  123  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  22.81 
 
 
669 aa  103  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  23.9 
 
 
706 aa  100  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.89 
 
 
674 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  21.41 
 
 
679 aa  91.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  25.08 
 
 
700 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  22.3 
 
 
675 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  23.51 
 
 
723 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  28.1 
 
 
484 aa  67.4  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  22.27 
 
 
579 aa  66.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  30.84 
 
 
562 aa  60.1  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  23.53 
 
 
505 aa  58.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  23.67 
 
 
579 aa  55.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  33.33 
 
 
684 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  25.86 
 
 
429 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  34.21 
 
 
782 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  24.57 
 
 
552 aa  49.7  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  25 
 
 
578 aa  50.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  24.57 
 
 
552 aa  48.9  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  25.86 
 
 
510 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2869  Alpha-galactosidase-like protein  21.76 
 
 
679 aa  46.6  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  21.08 
 
 
555 aa  45.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>