96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0962 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29290  alpha-L-arabinofuranosidase  61.9 
 
 		 551 aa  642    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.303495  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2782  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.09 
 
 		 507 aa  641    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0065  Alpha-N-arabinofuranosidase  63.41 
 
 		 510 aa  654    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0962  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 515 aa  1063    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0436846  decreased coverage  0.00620003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3528  Alpha-N-arabinofuranosidase  63.98 
 
 		 509 aa  661    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.841612 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0364  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.26 
 
 		 506 aa  634  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11700  alpha-L-arabinofuranosidase  61.45 
 
 		 552 aa  630  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.368447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3567  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.87 
 
 		 535 aa  628  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2727  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  53.28 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1255  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  50.4 
 
 		 492 aa  545  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.596115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1374  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.2 
 
 		 526 aa  541  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056945  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2249  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  51.02 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1237  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  49.8 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1118  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.49 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3612  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.7 
 
 		 521 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.102736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02260  alpha-N-arabinofuranosidase 2  48.21 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0475  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.6 
 
 		 525 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.726573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1767  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, D subunit  45.88 
 
 		 534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000390302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2415  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.56 
 
 		 529 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0753  Alpha-L-arabinofuranosidase  42.52 
 
 		 526 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1152  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.32 
 
 		 503 aa  342  7e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0328  Alpha-L-arabinofuranosidase  34.44 
 
 		 551 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48322  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4470  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  35.86 
 
 		 501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0994522  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0890  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.71 
 
 		 508 aa  272  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0631  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.58 
 
 		 484 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.99 
 
 		 484 aa  253  6e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01277  Alpha-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDV3]  33.41 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.779703  normal  0.226736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1817  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.79 
 
 		 548 aa  194  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0515  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.63 
 
 		 507 aa  188  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000302906  hitchhiker  0.000750208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4317  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.94 
 
 		 504 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341945  hitchhiker  0.00470977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5217  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.9 
 
 		 534 aa  173  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5583  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.03 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.759858  normal  0.105411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07120  alpha-L-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 525 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2575  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.52 
 
 		 512 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0202  alpha-L-arabinofuranosidase domain-containing protein  27.47 
 
 		 505 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.0476441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1037  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.79 
 
 		 503 aa  167  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1735  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.8 
 
 		 514 aa  166  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00576907  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6803  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.92 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.905258 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5707  alpha-L-arabinofuranosidase  26.44 
 
 		 507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0195  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.22 
 
 		 508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00030  Alpha-L-arabinofuranosidase, putative  27.97 
 
 		 543 aa  162  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3261  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.44 
 
 		 501 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.232195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0598  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.59 
 
 		 501 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2725  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.15 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2894  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.49 
 
 		 501 aa  159  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121186  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5890  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.22 
 
 		 502 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1739  alpha-L-arabinofuranosidase  27.48 
 
 		 522 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29300  alpha-L-arabinofuranosidase  27.22 
 
 		 506 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3457  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.99 
 
 		 506 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3514  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.58 
 
 		 499 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0643096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2548  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.66 
 
 		 503 aa  156  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2485  alpha-N-arabinofuranosidase  28.94 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0107043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0412  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.11 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1103  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.71 
 
 		 505 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3590  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.43 
 
 		 507 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0226  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.46 
 
 		 515 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2712  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.35 
 
 		 502 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1169  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.2 
 
 		 499 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.940985  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0383  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.74 
 
 		 511 aa  150  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6250  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.54 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.522312 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1339  alpha-L-arabinofuranosidase  27.22 
 
 		 515 aa  147  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0755  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.43 
 
 		 507 aa  147  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.426486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3225  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.1 
 
 		 511 aa  144  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111219  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0924  alpha-L-arabinofuranosidase  26.52 
 
 		 566 aa  144  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1036  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.1 
 
 		 501 aa  143  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0176098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1930  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.98 
 
 		 500 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00284341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1221  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  28.19 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2206  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.48 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05510  alpha-L-arabinofuranosidase  27.19 
 
 		 527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.594598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1521  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.62 
 
 		 778 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.272039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0181  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.01 
 
 		 549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4460  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  49.6 
 
 		 732 aa  133  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.551805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3208  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.31 
 
 		 703 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3212  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.89 
 
 		 684 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.968996  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4336  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 662 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0504519  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4945  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  25.67 
 
 		 660 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4495  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  27.76 
 
 		 772 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.183163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2410  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.56 
 
 		 691 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00000000106036  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3113  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.59 
 
 		 661 aa  77.8  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0658  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.94 
 
 		 634 aa  73.6  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0633  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.94 
 
 		 644 aa  73.6  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1739  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.4 
 
 		 824 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0331952  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1541  alpha-L-arabinofuranosidase  29.53 
 
 		 821 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3179  alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  29.46 
 
 		 704 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.784382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4027  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  28.57 
 
 		 704 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5739  alpha-L-arabinofuranosidase domain protein  29.03 
 
 		 855 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393547  normal  0.654215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  30.95 
 
 		 679 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1857  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.29 
 
 		 826 aa  60.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0330  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.1 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  27.92 
 
 		 699 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0048  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  29.94 
 
 		 959 aa  53.9  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0895  alpha-L-arabinofuranosidase  26.26 
 
 		 732 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3118  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  26.78 
 
 		 818 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222033  normal  0.0458046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6262  Alpha-L-arabinofuranosidase-like protein  24.77 
 
 		 483 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1789  putative alpha-L-arabinofuranosidase  26.67 
 
 		 550 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0379328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  29.27 
 
 		 719 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>