257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0078 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 
149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0381  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48.57 
 
 
143 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.99 
 
 
146 aa  120  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45 
 
 
143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2428  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.41 
 
 
145 aa  118  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.422045  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1505  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.53 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  48.28 
 
 
227 aa  94  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  42.98 
 
 
221 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.5 
 
 
218 aa  90.9  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  35.07 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  35.07 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  34.59 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.09 
 
 
239 aa  83.6  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  42.86 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  33.86 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  42.86 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  42.98 
 
 
226 aa  80.9  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  38.85 
 
 
239 aa  80.9  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.94 
 
 
232 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  43.97 
 
 
221 aa  80.5  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.48 
 
 
226 aa  80.1  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  44.64 
 
 
227 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  36.75 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  41.67 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.2 
 
 
224 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  41.44 
 
 
236 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  41.27 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  38.52 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  38.52 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.46 
 
 
238 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  38.52 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  39.32 
 
 
222 aa  77.8  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.22 
 
 
227 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 
219 aa  77  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  38.52 
 
 
230 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  38.79 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.55 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.79 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  38.52 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  39.84 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.86 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.79 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  38.52 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  40.87 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  34.31 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  35.25 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  38.89 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  41.8 
 
 
250 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.71 
 
 
229 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  38.94 
 
 
217 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  39.82 
 
 
218 aa  73.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.59 
 
 
225 aa  73.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.7 
 
 
216 aa  73.6  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.4 
 
 
230 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.71 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  37.4 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  41.12 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  37.4 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.35 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  34.29 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.12 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.05 
 
 
221 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  35.54 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  36.72 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.5 
 
 
234 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.59 
 
 
228 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  40.16 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
235 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.32 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.03 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.09 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  39.82 
 
 
244 aa  71.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.84 
 
 
227 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.34 
 
 
236 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  33.33 
 
 
236 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.03 
 
 
227 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.98 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.21 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  36.89 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  34.51 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  32.03 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  37.9 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  33.82 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  33.58 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  39.02 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.75 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.27 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.19 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.77 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.47 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  34.43 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  36.13 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  42.86 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  40.18 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.71 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  39.13 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  38.39 
 
 
236 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.59 
 
 
232 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.39 
 
 
235 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>