More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3344 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  28.47 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  30.97 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  33.57 
 
 		 277 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.91 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000483446  hitchhiker  0.0000000000012349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  37.06 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  25.9 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0737  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.65 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1767  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000240026 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  29.93 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  30.28 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3555  universal stress protein family protein  28.85 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  25.9 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41880  universal stress protein  28.85 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  28.37 
 
 		 212 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  30.28 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  30.28 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  30.28 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  30.28 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  30.28 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  30.28 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  30.28 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  28.06 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  31.43 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  27.74 
 
 		 296 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  30.61 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  26.95 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  28.17 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  32.87 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  31.29 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  32.12 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  31.03 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  28.66 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  30.28 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.94 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  28.17 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27981  universal stress protein  32.62 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  29.17 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  26.06 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  31.69 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  26.06 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  25.97 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 289 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  26.92 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.57 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  27.54 
 
 		 152 aa  52.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.5 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.37 
 
 		 288 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  30.61 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  27.54 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  26.95 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.76 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  25.48 
 
 		 167 aa  52  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  33.1 
 
 		 281 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  27.86 
 
 		 295 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  27.66 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  30.82 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.26 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  25 
 
 		 167 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000472572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  28.15 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.14 
 
 		 307 aa  51.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.86 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  30.88 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  28.57 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  28.97 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  32.47 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  28.67 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  33.57 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  26.09 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  27.39 
 
 		 515 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  23.29 
 
 		 281 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.61 
 
 		 276 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  27.14 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>