223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27981 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_27981  universal stress protein  100 
 
 
127 aa  253  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  52.59 
 
 
135 aa  140  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  51.85 
 
 
135 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  51.09 
 
 
137 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  51.09 
 
 
137 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  51.09 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1115  hypothetical protein  52.71 
 
 
126 aa  127  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.198517  normal  0.698975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3375  hypothetical protein  46.32 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0959  UspA domain protein  46.56 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  0.295172 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  33.09 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  34.03 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  33.33 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  34.04 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  28.89 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.43 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  35.66 
 
 
281 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  31.91 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  32.62 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.33 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  31.65 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  32.14 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  29.27 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.51 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  30 
 
 
301 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  30.66 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  30.88 
 
 
281 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  28.66 
 
 
164 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  32.65 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.41 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  28.28 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  31.16 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  29.29 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  32.12 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  28 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  32.37 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  30.77 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.43 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  30.53 
 
 
306 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  30.97 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  29.08 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.75 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  31.94 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  34.31 
 
 
207 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  30.56 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  29.73 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.61 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.33 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  43.64 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.86 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  24.53 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  29.85 
 
 
287 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  33.08 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.19 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  26.03 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  43.64 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000483446  hitchhiker  0.0000000000012349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  43.64 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.58 
 
 
288 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  28.24 
 
 
306 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  26.76 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  30.56 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.43 
 
 
290 aa  47.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  32.41 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  41.1 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  27.08 
 
 
143 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  30.87 
 
 
187 aa  47.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.33 
 
 
314 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  30.77 
 
 
283 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.43 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  32.58 
 
 
280 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  32.89 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  28.08 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  27.34 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  32.85 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  25.52 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>