More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1322 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 546 aa  1079    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  53.49 
 
 		 510 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  46.59 
 
 		 537 aa  434  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  44.03 
 
 		 549 aa  414  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  45.42 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  29.92 
 
 		 484 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  29.67 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  29.01 
 
 		 507 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  29.03 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  31.76 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  30.13 
 
 		 558 aa  161  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  40.24 
 
 		 388 aa  159  9e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  26.23 
 
 		 566 aa  156  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  30.79 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  31.19 
 
 		 388 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  30.81 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  30.52 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  32.49 
 
 		 564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  37.22 
 
 		 474 aa  73.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 843 aa  71.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  30.48 
 
 		 477 aa  70.1  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  27.32 
 
 		 607 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  30.65 
 
 		 681 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0672  preprotein translocase subunit SecD  31.46 
 
 		 586 aa  67  0.0000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  30.61 
 
 		 622 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  30.77 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  28.44 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  29.64 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  26.83 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  33.15 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  29.49 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  28.85 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  28.85 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  31.31 
 
 		 495 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  27.78 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  27.88 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  29.7 
 
 		 595 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  34.25 
 
 		 613 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  29.44 
 
 		 605 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 613 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  30.36 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  31.72 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  32.51 
 
 		 503 aa  62  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  27.86 
 
 		 638 aa  62  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  34.25 
 
 		 613 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  27.62 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  32.24 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  26.74 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  26.04 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  30 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  25.13 
 
 		 735 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  30 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  27.31 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  27.01 
 
 		 594 aa  60.1  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  29.21 
 
 		 535 aa  60.1  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  27.54 
 
 		 603 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  29.51 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  28.86 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  30.1 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  28.43 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  31 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  28.49 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1240  protein translocase subunit  31.69 
 
 		 622 aa  59.3  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00253338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  30.81 
 
 		 734 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  28.43 
 
 		 533 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  22.97 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0701  preprotein translocase subunit SecD  29.59 
 
 		 687 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  30.46 
 
 		 684 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  28.06 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  32.21 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0417  putative protein-export membrane protein SecF  21.89 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  28.49 
 
 		 632 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  28.65 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3992  preprotein translocase subunit SecD  28.99 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.725975  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  28.57 
 
 		 680 aa  57  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  31.68 
 
 		 512 aa  57  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  28.65 
 
 		 614 aa  57  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1323  protein-export membrane protein SecD  29.17 
 
 		 611 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.970602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  27.37 
 
 		 521 aa  56.6  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  27.32 
 
 		 510 aa  57  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0599  protein-export membrane protein SecD  29.28 
 
 		 612 aa  56.2  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  30.94 
 
 		 793 aa  56.6  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  31.15 
 
 		 622 aa  57  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  26.1 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  28.46 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  26.54 
 
 		 416 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  28.52 
 
 		 496 aa  55.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  25.77 
 
 		 316 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  27.42 
 
 		 632 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  28 
 
 		 307 aa  55.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  26.63 
 
 		 526 aa  55.5  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  26.46 
 
 		 594 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  26.46 
 
 		 594 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  30.05 
 
 		 615 aa  54.7  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  26.36 
 
 		 410 aa  54.3  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  27.7 
 
 		 622 aa  54.7  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.71 
 
 		 1400 aa  54.3  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  27.78 
 
 		 584 aa  54.3  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.29 
 
 		 995 aa  54.3  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1021  preprotein translocase subunit SecD  30.39 
 
 		 604 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>