208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1204 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 
335 aa  696    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  37.28 
 
 
325 aa  176  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  33.11 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  35.43 
 
 
314 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  34.84 
 
 
322 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  32.52 
 
 
322 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  35.29 
 
 
306 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  29.15 
 
 
316 aa  135  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.76 
 
 
298 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  31.58 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  33.92 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  32.42 
 
 
282 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  39.66 
 
 
357 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  34 
 
 
280 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.55 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.61 
 
 
464 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.35 
 
 
323 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.7 
 
 
363 aa  96.3  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.38 
 
 
322 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.34 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  27.71 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  27.37 
 
 
309 aa  93.6  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  32.44 
 
 
336 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  32.88 
 
 
244 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  26.69 
 
 
308 aa  92.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  28.24 
 
 
795 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.28 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  32.98 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  28.52 
 
 
361 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  26.92 
 
 
398 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  34.95 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  24.68 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  32.34 
 
 
1002 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.05 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  32.05 
 
 
471 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  26.18 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.57 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.41 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  26.95 
 
 
398 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  30.72 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.85 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  36.92 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.26 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3823  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.41 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  36.84 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  26.27 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  25.81 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  29.55 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  25.1 
 
 
406 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  24.56 
 
 
369 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  26.97 
 
 
659 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  25.44 
 
 
398 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  29.74 
 
 
429 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5113  esterase, PHB depolymerase  27.82 
 
 
370 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  23.21 
 
 
367 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  26.4 
 
 
414 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  23.21 
 
 
367 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  31.82 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  23.57 
 
 
364 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  31.82 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  31.82 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  23.21 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  23.21 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  23.21 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  23.21 
 
 
382 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  23.21 
 
 
364 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  31.82 
 
 
369 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  26.51 
 
 
486 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  27.27 
 
 
317 aa  59.7  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2820  esterase, PHB depolymerase family  23.36 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000611867  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  29.95 
 
 
265 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  29.55 
 
 
461 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1368  phospholipase/Carboxylesterase  28.22 
 
 
239 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  30.37 
 
 
429 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  31.69 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  31.69 
 
 
344 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  23.18 
 
 
276 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  29.55 
 
 
260 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  30.65 
 
 
417 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  24.91 
 
 
422 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  33.85 
 
 
438 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  27.39 
 
 
367 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0185  hypothetical protein  29.08 
 
 
446 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000162284  hitchhiker  0.000128495 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.37 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  31.16 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  32.2 
 
 
395 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  29.31 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  29.53 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2179  esterase, PHB depolymerase family  32.5 
 
 
419 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7221  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201442  normal  0.80823 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  27.83 
 
 
416 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3949  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25.26 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.994388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  32.5 
 
 
683 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  32.5 
 
 
683 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  29.86 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1208  phospholipase/carboxylesterase  27.61 
 
 
239 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  30.34 
 
 
363 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  31.76 
 
 
450 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  28.06 
 
 
312 aa  53.9  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>