More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1019 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  100 
 
 		 694 aa  1403    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  45.58 
 
 		 701 aa  560  1e-158  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  37.18 
 
 		 763 aa  439  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  37.46 
 
 		 763 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  35.96 
 
 		 737 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  36.56 
 
 		 715 aa  435  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  35.58 
 
 		 737 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  35.09 
 
 		 752 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  37.16 
 
 		 706 aa  428  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  36.82 
 
 		 759 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  36.38 
 
 		 720 aa  425  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  33.74 
 
 		 827 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  33.88 
 
 		 828 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  35.43 
 
 		 735 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  37.61 
 
 		 749 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  33.74 
 
 		 827 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  37.61 
 
 		 736 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  33.74 
 
 		 827 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  36.56 
 
 		 755 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  33.74 
 
 		 812 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  33.74 
 
 		 896 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  33.74 
 
 		 838 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  33.74 
 
 		 886 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  33.88 
 
 		 895 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  33.74 
 
 		 896 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  35.01 
 
 		 840 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  33.74 
 
 		 817 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  33.74 
 
 		 838 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  33.74 
 
 		 838 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  33.74 
 
 		 817 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  34.54 
 
 		 1055 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  34.28 
 
 		 817 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  33.74 
 
 		 818 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  34.82 
 
 		 861 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  35.78 
 
 		 746 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  33.75 
 
 		 857 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  35.78 
 
 		 746 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  35.09 
 
 		 805 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  34.96 
 
 		 758 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  33.61 
 
 		 857 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  33.78 
 
 		 876 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  34.15 
 
 		 859 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  33.43 
 
 		 777 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  37.46 
 
 		 716 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  33.19 
 
 		 857 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  34.41 
 
 		 801 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  33.11 
 
 		 870 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  37.1 
 
 		 788 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  33.62 
 
 		 722 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  33.91 
 
 		 818 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  34.87 
 
 		 833 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  34.87 
 
 		 833 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  38.75 
 
 		 751 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  38.91 
 
 		 751 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  33.98 
 
 		 828 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  33.67 
 
 		 937 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  35.7 
 
 		 762 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  35.31 
 
 		 758 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  36.36 
 
 		 706 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2700  ribonuclease R  33.93 
 
 		 796 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.749256  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  32.69 
 
 		 910 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  34.15 
 
 		 906 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  32.86 
 
 		 803 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2988  ribonuclease R  33 
 
 		 771 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216479 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  39.13 
 
 		 757 aa  392  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  34.29 
 
 		 907 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  33.65 
 
 		 864 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  35.62 
 
 		 858 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  33.83 
 
 		 848 aa  389  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  33.48 
 
 		 819 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1938  ribonuclease R  32.81 
 
 		 829 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.751615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  35.61 
 
 		 709 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2855  ribonuclease R  34.39 
 
 		 733 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  33.29 
 
 		 813 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  33.43 
 
 		 813 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  32.21 
 
 		 871 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1240  ribonuclease R  32.85 
 
 		 764 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  33.29 
 
 		 813 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  33.29 
 
 		 813 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  36.42 
 
 		 708 aa  385  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  33.29 
 
 		 813 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  33.29 
 
 		 813 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  33.94 
 
 		 770 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  33.76 
 
 		 710 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  33.29 
 
 		 813 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2568  ribonuclease R  32.85 
 
 		 764 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0166651 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  33.48 
 
 		 710 aa  382  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  33.29 
 
 		 813 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  33.29 
 
 		 813 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  33.29 
 
 		 834 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1983  exoribonuclease II  34.21 
 
 		 744 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  35.74 
 
 		 857 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  33.09 
 
 		 876 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1425  ribonuclease R  33.33 
 
 		 752 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  33.43 
 
 		 826 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  34.16 
 
 		 833 aa  382  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  34.23 
 
 		 903 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  32.29 
 
 		 812 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  32.29 
 
 		 812 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  35.39 
 
 		 770 aa  379  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>