More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0817 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  439  1e-122  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  53.68 
 
 
200 aa  211  6e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  47.74 
 
 
202 aa  191  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 
213 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
228 aa  114  8e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
207 aa  79  5e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
238 aa  78.6  6e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 
214 aa  72.4  4e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  9.67411e-09 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 
243 aa  72.8  4e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
324 aa  70.1  2e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
210 aa  69.7  3e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
207 aa  70.1  3e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
191 aa  68.2  9e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
218 aa  68.2  9e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
210 aa  67  2e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  30.26 
 
 
206 aa  66.6  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
205 aa  67.4  2e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
207 aa  65.9  4e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
184 aa  66.2  4e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  8.72016e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 
194 aa  65.5  5e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
196 aa  65.9  5e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
227 aa  65.1  8e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
278 aa  64.7  9e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
278 aa  64.7  9e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
278 aa  64.7  9e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 
207 aa  63.9  1e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 
246 aa  64.7  1e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 
204 aa  64.3  1e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
234 aa  64.3  1e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
203 aa  63.5  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
277 aa  63.5  2e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
204 aa  63.5  2e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 
209 aa  63.2  3e-09  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
202 aa  62.8  3e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 
231 aa  63.2  3e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 
208 aa  63.2  3e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
209 aa  63.2  3e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
216 aa  62.4  4e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
233 aa  62.8  4e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 
203 aa  62.8  4e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  30.7 
 
 
208 aa  62.8  4e-09  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
269 aa  62.4  4e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
283 aa  62.4  5e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
188 aa  62.4  5e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 
231 aa  62.4  5e-09  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
221 aa  62  6e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
210 aa  62  6e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 
189 aa  62  7e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  29.19 
 
 
213 aa  60.8  1e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
198 aa  60.8  1e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
208 aa  61.2  1e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
224 aa  61.2  1e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 
275 aa  61.2  1e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 
205 aa  61.2  1e-08  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  28.3 
 
 
239 aa  61.2  1e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
216 aa  61.2  1e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  28 
 
 
196 aa  60.5  2e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 
275 aa  60.5  2e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
217 aa  60.1  2e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
232 aa  60.8  2e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 
225 aa  60.5  2e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
200 aa  60.5  2e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 
190 aa  60.5  2e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 
224 aa  60.1  2e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  42.42 
 
 
220 aa  60.1  2e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
233 aa  60.1  2e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 
214 aa  60.5  2e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 
208 aa  59.7  3e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 
210 aa  59.7  3e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
189 aa  59.7  3e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 
207 aa  59.7  3e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 
216 aa  59.7  3e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
206 aa  59.7  3e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
210 aa  60.1  3e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 
219 aa  59.3  4e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
200 aa  59.3  4e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  25.88 
 
 
208 aa  59.7  4e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  32.08 
 
 
230 aa  59.3  4e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 
193 aa  59.3  4e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
210 aa  59.3  4e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
238 aa  59.3  4e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 
193 aa  58.9  5e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
209 aa  58.9  5e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
233 aa  58.9  5e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
197 aa  59.3  5e-08  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 
218 aa  58.9  6e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  23.6 
 
 
241 aa  58.9  6e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 
210 aa  58.9  6e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
216 aa  58.5  6e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
206 aa  58.5  6e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
219 aa  58.5  6e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
263 aa  58.5  7e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
258 aa  58.5  7e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
256 aa  58.5  7e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 
205 aa  58.2  8e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 
271 aa  58.2  8e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
224 aa  58.2  8e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
190 aa  58.2  9e-08  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 
228 aa  57.4  1e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  43.28 
 
 
226 aa  57.8  1e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>