201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2248 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2248  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 182 aa  377  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  44.52 
 
 		 357 aa  142  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 		 373 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 815 aa  107  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 677 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 711 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 719 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 548 aa  98.6  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 1017 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 545 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 544 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 1014 aa  92.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 		 571 aa  90.9  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2079  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  33.53 
 
 		 505 aa  90.9  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  37.76 
 
 		 438 aa  88.6  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 		 574 aa  87.8  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.12 
 
 		 356 aa  87.8  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 545 aa  87  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 366 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  32.69 
 
 		 374 aa  84.3  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 726 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.53 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 911 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 905 aa  81.3  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  34.88 
 
 		 562 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 		 565 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 602 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 884 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3639  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  29.63 
 
 		 547 aa  75.1  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00185015  normal  0.0105552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 755 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 885 aa  72  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 		 864 aa  71.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  28.4 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0907  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 880 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2133  GGDEF family protein  28.85 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.352584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1939  GAF domain/His kinase A domain/HD domain-containing protein  30.71 
 
 		 787 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 703 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 		 770 aa  67.8  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 		 703 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 634 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000423635  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.04 
 
 		 858 aa  65.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 2161 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 		 710 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  26.92 
 
 		 688 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 859 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3785  putative GAF sensor protein  33.04 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.674833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.06 
 
 		 704 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.97 
 
 		 686 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3644  putative GAF sensor protein  33.02 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  29.22 
 
 		 612 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1211 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  32.03 
 
 		 681 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.47 
 
 		 713 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3702  putative GAF sensor protein  33.04 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0945688  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  29.14 
 
 		 414 aa  61.2  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.41 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.93 
 
 		 1017 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.55 
 
 		 1004 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  35.64 
 
 		 738 aa  58.9  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  37.8 
 
 		 971 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2866  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.71 
 
 		 448 aa  58.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 2153 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 748 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  24.39 
 
 		 554 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.61 
 
 		 995 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  29.17 
 
 		 644 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2183  diguanylate cyclase with GAF sensor  25 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  37.08 
 
 		 736 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  27.06 
 
 		 536 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0421  putative phytochrome sensor protein  31.52 
 
 		 770 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 2783 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 403 aa  55.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2004  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 582 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.356551  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  26.35 
 
 		 692 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  27.04 
 
 		 637 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3116  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 429 aa  55.1  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 403 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  25.61 
 
 		 665 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4649  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 533 aa  54.3  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3744  putative GAF sensor protein  26.62 
 
 		 323 aa  54.3  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 		 903 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 1174 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 399 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  24.38 
 
 		 712 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0035  NifA subfamily transcriptional regulator  29.68 
 
 		 564 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.33 
 
 		 1020 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  28.99 
 
 		 584 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 401 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 401 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 401 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  26.77 
 
 		 639 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 662 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 647 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2264  putative GAF sensor protein  26.06 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1316  response regulator  26.71 
 
 		 324 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 		 539 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 		 392 aa  52.4  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3238  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  23.21 
 
 		 662 aa  52  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0144494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>