More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1991 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1939  GAF domain/His kinase A domain/HD domain-containing protein  71.87 
 
 
787 aa  1156    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
755 aa  1536    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423484  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  34.08 
 
 
371 aa  195  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  32.66 
 
 
357 aa  193  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
770 aa  189  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 
373 aa  174  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  31.52 
 
 
718 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 
703 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  28.7 
 
 
710 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 
703 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
719 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  27.22 
 
 
692 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  29.71 
 
 
649 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.72 
 
 
880 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.72 
 
 
860 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  30.69 
 
 
712 aa  151  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 
574 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  39.49 
 
 
465 aa  144  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  27.83 
 
 
650 aa  140  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  31.8 
 
 
363 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 
374 aa  138  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 
366 aa  138  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 
553 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 
405 aa  137  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 
1171 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  27.3 
 
 
392 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 
648 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 
452 aa  135  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  40.62 
 
 
495 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  29.7 
 
 
632 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  28.3 
 
 
848 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  39.55 
 
 
453 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
547 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
547 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  37.5 
 
 
876 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 
481 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  41.21 
 
 
545 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  29.35 
 
 
1237 aa  130  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
505 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.24 
 
 
681 aa  129  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  32.49 
 
 
771 aa  129  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  41.22 
 
 
487 aa  129  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  31.69 
 
 
387 aa  129  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 
407 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  37.14 
 
 
563 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  36.04 
 
 
451 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  31.64 
 
 
548 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
298 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  39.87 
 
 
197 aa  125  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  29.87 
 
 
740 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  40.25 
 
 
177 aa  124  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  35.79 
 
 
564 aa  124  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0051  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 
407 aa  124  8e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.64 
 
 
343 aa  124  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.47 
 
 
483 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
326 aa  123  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  42.36 
 
 
438 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
571 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 
339 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 
561 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2424  HD-GYP domain-containing protein  32.41 
 
 
400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 
428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.64 
 
 
502 aa  122  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  27.46 
 
 
1333 aa  121  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 
571 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0111  metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 
228 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.153504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  32.5 
 
 
550 aa  120  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
451 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 
719 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  30.45 
 
 
636 aa  120  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 
618 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  41.26 
 
 
331 aa  120  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 
480 aa  120  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 
328 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 
247 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  26.86 
 
 
403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  35.75 
 
 
334 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  36.96 
 
 
339 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
207 aa  118  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 
1301 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.5 
 
 
1125 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  42.65 
 
 
210 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0348  sensory box protein  37.18 
 
 
212 aa  118  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
430 aa  118  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  40 
 
 
471 aa  118  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 
364 aa  117  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 
220 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 
389 aa  117  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 
526 aa  117  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 
229 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
469 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  40.14 
 
 
619 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  25.8 
 
 
562 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
320 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  42.21 
 
 
353 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  37.5 
 
 
509 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 
314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.82 
 
 
346 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>