More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2424 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2424  HD-GYP domain-containing protein  100 
 
 
400 aa  801    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  36.4 
 
 
366 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  34.06 
 
 
550 aa  150  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 
363 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  36.44 
 
 
553 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 
548 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 
371 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 
770 aa  143  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  34.82 
 
 
373 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  34.73 
 
 
703 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  35.15 
 
 
703 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
357 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 
692 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  31.82 
 
 
712 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  35.39 
 
 
719 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 
374 aa  126  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 
495 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  33.21 
 
 
448 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 
1073 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 
718 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 
710 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
452 aa  123  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
755 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423484  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 
718 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  39.32 
 
 
518 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
550 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 
508 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 
635 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.1 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  32.97 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 
648 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 
487 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  35.08 
 
 
451 aa  117  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 
414 aa  116  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  35.9 
 
 
350 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  39.64 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 
512 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.5 
 
 
379 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 
496 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  37.13 
 
 
353 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  32.69 
 
 
740 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  40.54 
 
 
599 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.22 
 
 
841 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  36.03 
 
 
1333 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  38.59 
 
 
320 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 
177 aa  113  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  36.13 
 
 
836 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 
430 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  36.13 
 
 
792 aa  112  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 
571 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  34.9 
 
 
509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 
861 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 
574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.6 
 
 
880 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1246  metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 
632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1178  metal dependent phosphohydrolase  39.34 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.9 
 
 
348 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 
357 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 
357 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
487 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 
357 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 
498 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.2 
 
 
860 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
698 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
298 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  34.72 
 
 
563 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
403 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  35.08 
 
 
505 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
710 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 
526 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 
506 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
451 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  33.07 
 
 
1335 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 
311 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 
347 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 
615 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 
649 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 
378 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
713 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 
320 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  40.2 
 
 
499 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  34.11 
 
 
650 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  33.72 
 
 
1313 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  34.55 
 
 
564 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 
446 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  35.08 
 
 
197 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 
389 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 
347 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
636 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
324 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 
483 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>