221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2793 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 76 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  72.06 
 
 		 76 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  65.22 
 
 		 72 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  63.24 
 
 		 72 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  57.33 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0577  XRE family transcriptional regulator  69.81 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 74 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  53.85 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6540  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  43.84 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  53.97 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  53.97 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50.82 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  38.46 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3025  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0669  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  41.18 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  45.31 
 
 		 80 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  45 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5389  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9535  hypothetical transcription regulator protein  40.62 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111117  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 199 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.19 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  34.33 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  41.94 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 84 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.39 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4969  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  44.26 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.54 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.35 
 
 		 267 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>