More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0813 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  100 
 
 		 427 aa  882    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  65.57 
 
 		 453 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  37.82 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  38.46 
 
 		 414 aa  266  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  36.84 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  33.1 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  32.81 
 
 		 439 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  33.93 
 
 		 449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  32.21 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  31.93 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.65 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  30.42 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.81 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  28.07 
 
 		 413 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  25.58 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  24.65 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  27.94 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  25 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  24.25 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  26.1 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  28.57 
 
 		 415 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  23.96 
 
 		 403 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  25.3 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 444 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  26.03 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.41 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  24.31 
 
 		 398 aa  99.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  25.4 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  25.84 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  24.42 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  26.33 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  24.47 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  25.46 
 
 		 395 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 412 aa  97.1  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  28 
 
 		 419 aa  96.7  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.48 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  25.69 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  25.17 
 
 		 402 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  23.27 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  23.57 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  24.24 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  23.57 
 
 		 409 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  23.57 
 
 		 409 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  24.32 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  24.41 
 
 		 405 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  26.15 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5552  integrase family protein  31.58 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  25.99 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  23.61 
 
 		 400 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1028  Phage integrase  30.04 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214982  normal  0.0128497 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  33.17 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  25.47 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  26.42 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  27.67 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  26.74 
 
 		 434 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  25.14 
 
 		 420 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  23.15 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  24.2 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  26.12 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  23.46 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  22.8 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  25.58 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  25.29 
 
 		 404 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  24.94 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  30.52 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  24.37 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  23.13 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  24.49 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  26.79 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  25.84 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  25.57 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 426 aa  87  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  23.68 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  25.07 
 
 		 402 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  25 
 
 		 404 aa  86.3  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  25.23 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  23.25 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  23.74 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  24.21 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  27.01 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  23.2 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  23.81 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  24.88 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  24.44 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  24.54 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  23.89 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  21.99 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  24.22 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  26.44 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  23.01 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1914  integrative genetic element Gsu32, integrase, putative  31.94 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  24.93 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>