183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0018 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  81.72 
 
 
648 aa  1003    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  100 
 
 
723 aa  1483    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  76.63 
 
 
641 aa  938    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  87.77 
 
 
714 aa  1228    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  36.38 
 
 
648 aa  343  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  33.22 
 
 
670 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  32.5 
 
 
651 aa  302  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  33.51 
 
 
713 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  34.74 
 
 
559 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  32.93 
 
 
665 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  32.8 
 
 
687 aa  278  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  35.43 
 
 
593 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  34.11 
 
 
669 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  32.36 
 
 
665 aa  273  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  35.47 
 
 
594 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  32.24 
 
 
666 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  35.17 
 
 
673 aa  271  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  34.05 
 
 
667 aa  270  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  32.25 
 
 
666 aa  270  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  31.53 
 
 
668 aa  270  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  35.46 
 
 
664 aa  270  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  33.72 
 
 
669 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  34.9 
 
 
663 aa  270  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  31.79 
 
 
675 aa  270  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  35.04 
 
 
576 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  35.09 
 
 
678 aa  269  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  35.1 
 
 
670 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  32.06 
 
 
663 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  32.78 
 
 
660 aa  268  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  34.19 
 
 
664 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  33.85 
 
 
672 aa  267  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  34.1 
 
 
669 aa  267  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  35.59 
 
 
664 aa  267  5.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  33.72 
 
 
665 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0180  hypothetical protein  33.6 
 
 
633 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  34.82 
 
 
633 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  36.03 
 
 
573 aa  265  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  34.87 
 
 
570 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  33.15 
 
 
661 aa  264  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  33.66 
 
 
661 aa  263  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  33.92 
 
 
700 aa  263  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  31.79 
 
 
661 aa  263  8e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  31.02 
 
 
661 aa  263  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  33.63 
 
 
575 aa  262  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  27.53 
 
 
687 aa  261  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  34.43 
 
 
570 aa  261  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  33.75 
 
 
669 aa  261  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  32.02 
 
 
660 aa  261  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  34.76 
 
 
557 aa  260  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  31.88 
 
 
583 aa  260  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  34.83 
 
 
661 aa  259  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  30.84 
 
 
666 aa  259  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  35.61 
 
 
664 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  32.57 
 
 
662 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  30.9 
 
 
676 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  32.69 
 
 
663 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  32.69 
 
 
663 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  32.33 
 
 
659 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  33.14 
 
 
659 aa  258  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  34.79 
 
 
674 aa  257  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  33.48 
 
 
660 aa  256  8e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  33 
 
 
662 aa  256  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  34.16 
 
 
661 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  32.31 
 
 
665 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  34.69 
 
 
662 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  34.13 
 
 
660 aa  253  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  32.69 
 
 
666 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  32.87 
 
 
661 aa  252  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  28.79 
 
 
758 aa  249  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  32.36 
 
 
677 aa  249  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  34.65 
 
 
823 aa  248  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  32.62 
 
 
548 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  33.7 
 
 
666 aa  248  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  34.12 
 
 
663 aa  240  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7522  TRAG family protein  32.89 
 
 
601 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.445518  normal  0.175078 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  28.37 
 
 
695 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0170  cmgd4  28.98 
 
 
658 aa  234  3e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.035471  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  30.28 
 
 
661 aa  233  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  28.62 
 
 
723 aa  231  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  31.52 
 
 
756 aa  231  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  35.44 
 
 
670 aa  224  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  32.11 
 
 
603 aa  223  9e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  27.81 
 
 
699 aa  223  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  28.84 
 
 
678 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  29.08 
 
 
714 aa  219  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a021  conjugal transfer protein TraG/VirD4  32.3 
 
 
598 aa  217  7e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  28.14 
 
 
699 aa  216  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  33.41 
 
 
809 aa  208  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6612  conjugal transfer coupling protein TraG  30.89 
 
 
637 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6525  conjugal transfer coupling protein TraG  30.89 
 
 
637 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.646585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  32.74 
 
 
828 aa  207  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1699  TraG/TraD family protein  33.18 
 
 
834 aa  206  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4317  conjugal transfer coupling protein TraG  30.07 
 
 
634 aa  205  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.184857  normal 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0017  conjugal transfer protein TraK  27.97 
 
 
655 aa  203  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  29.22 
 
 
630 aa  203  9e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4715  conjugal transfer coupling protein TraG  28.49 
 
 
626 aa  203  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2248  conjugal transfer coupling protein TraG  28.97 
 
 
644 aa  193  9e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0479  TRAG family protein  30.89 
 
 
531 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0023  conjugal transfer protein  25.59 
 
 
673 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0025  conjugal transfer coupling protein TraG  30 
 
 
645 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000549825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>