130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0246 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  100 
 
 		 537 aa  1073    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  75.73 
 
 		 558 aa  802    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  58.25 
 
 		 516 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  51.32 
 
 		 605 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  41.84 
 
 		 579 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  41.57 
 
 		 587 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  43.52 
 
 		 565 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  41.33 
 
 		 609 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  38.86 
 
 		 557 aa  347  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  38.09 
 
 		 606 aa  327  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  37.04 
 
 		 558 aa  326  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  36.84 
 
 		 558 aa  326  7e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  36.84 
 
 		 558 aa  326  7e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.11 
 
 		 552 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.11 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.11 
 
 		 552 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  35.16 
 
 		 603 aa  302  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  34.66 
 
 		 552 aa  300  3e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  36.51 
 
 		 606 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.02 
 
 		 576 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  33.74 
 
 		 869 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  30.26 
 
 		 920 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  30.25 
 
 		 869 aa  98.6  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 919 aa  97.8  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  26.91 
 
 		 897 aa  97.4  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 931 aa  95.9  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  32.29 
 
 		 827 aa  94.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 779 aa  95.1  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  30.21 
 
 		 828 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 910 aa  93.6  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  29.57 
 
 		 912 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 921 aa  91.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  29.69 
 
 		 828 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  33.7 
 
 		 977 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  33.05 
 
 		 952 aa  90.5  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  32.27 
 
 		 833 aa  90.1  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  33.5 
 
 		 948 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  30.21 
 
 		 915 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  32.73 
 
 		 800 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  23.83 
 
 		 922 aa  87.8  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  27.08 
 
 		 803 aa  87.4  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  31.2 
 
 		 834 aa  87  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 919 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  26.12 
 
 		 753 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  24.49 
 
 		 869 aa  84.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  34.45 
 
 		 940 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  25.52 
 
 		 812 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.62 
 
 		 877 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  32.34 
 
 		 936 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 1055 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.57 
 
 		 877 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.98 
 
 		 781 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.34 
 
 		 800 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  31.72 
 
 		 823 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  30.51 
 
 		 947 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.11 
 
 		 875 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  26.53 
 
 		 849 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  31.72 
 
 		 830 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.54 
 
 		 568 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 852 aa  77  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  24.16 
 
 		 791 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  26.57 
 
 		 830 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  30.21 
 
 		 828 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  29.69 
 
 		 837 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.17 
 
 		 920 aa  70.5  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  29.69 
 
 		 837 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  29.69 
 
 		 837 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  25.45 
 
 		 846 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  23.43 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  26.27 
 
 		 824 aa  66.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  34.34 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.87 
 
 		 703 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  27.14 
 
 		 833 aa  63.9  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  25.95 
 
 		 700 aa  63.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 208 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  28.42 
 
 		 191 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  27.68 
 
 		 238 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 384 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  36.26 
 
 		 459 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  36.11 
 
 		 580 aa  54.7  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  25.44 
 
 		 495 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25 
 
 		 495 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  30.56 
 
 		 219 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  31.41 
 
 		 195 aa  51.6  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.29 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  31.41 
 
 		 196 aa  51.6  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  29.22 
 
 		 234 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  28.37 
 
 		 252 aa  51.2  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  29.03 
 
 		 235 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  31.48 
 
 		 187 aa  50.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  23.33 
 
 		 478 aa  50.4  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  31.79 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  27.1 
 
 		 196 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 205 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  34.26 
 
 		 191 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  30.32 
 
 		 191 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  34.09 
 
 		 456 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 196 aa  48.5  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>