More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1859 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 686 aa  1416    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 618 aa  160  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 634 aa  150  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  25.14 
 
 		 645 aa  134  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 671 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 673 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 616 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.62 
 
 		 646 aa  128  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 709 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 597 aa  125  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 638 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.57 
 
 		 616 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 705 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.58 
 
 		 653 aa  122  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 665 aa  120  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 669 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 679 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.39 
 
 		 641 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  25.76 
 
 		 656 aa  117  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  26.22 
 
 		 663 aa  114  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 702 aa  114  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 828 aa  114  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 663 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  26.22 
 
 		 663 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  26.22 
 
 		 663 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  26.22 
 
 		 659 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25.87 
 
 		 663 aa  112  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  25.73 
 
 		 650 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  25.87 
 
 		 663 aa  112  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  24.74 
 
 		 622 aa  111  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 661 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  25.56 
 
 		 650 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  25.56 
 
 		 650 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1382  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 655 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00890122  normal  0.0713693 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  26.48 
 
 		 631 aa  110  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 651 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  25.56 
 
 		 650 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 627 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 737 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 681 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  30.6 
 
 		 623 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3667  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 624 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 653 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  24.49 
 
 		 628 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 		 628 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  32.71 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.29 
 
 		 619 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 678 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 662 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0111  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 681 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.643916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 688 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0778  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 742 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 		 736 aa  101  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 682 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 1128 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3845  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 696 aa  100  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 621 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  27.27 
 
 		 650 aa  100  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 688 aa  100  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 656 aa  99.8  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 662 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 641 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2526  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 620 aa  99  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.995023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 635 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 648 aa  98.6  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 662 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 680 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 620 aa  97.8  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 614 aa  97.8  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  35.26 
 
 		 593 aa  97.1  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  36.31 
 
 		 637 aa  96.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  25.24 
 
 		 617 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 733 aa  95.5  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.2 
 
 		 613 aa  95.1  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  35.85 
 
 		 651 aa  95.1  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 649 aa  94.7  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 649 aa  94.7  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  33 
 
 		 633 aa  94.4  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  28.97 
 
 		 618 aa  94  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 714 aa  94  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  32.53 
 
 		 666 aa  94  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  35.8 
 
 		 613 aa  94  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 698 aa  94  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  31.02 
 
 		 652 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  41.86 
 
 		 620 aa  93.2  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  33.33 
 
 		 618 aa  93.6  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  24.11 
 
 		 695 aa  93.2  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  24.16 
 
 		 623 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  41.86 
 
 		 697 aa  92.8  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  23.24 
 
 		 792 aa  93.2  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 619 aa  92.8  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1253  TonB-dependent receptor, plug  27.53 
 
 		 702 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.98016  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  37.58 
 
 		 1023 aa  92  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  33.82 
 
 		 668 aa  92  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  34.13 
 
 		 681 aa  92.4  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 621 aa  92.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 615 aa  91.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 701 aa  91.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 638 aa  92  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 724 aa  91.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>