More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2473 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 199 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  47.09 
 
 		 190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  47.77 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  44.07 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  44.07 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  42.39 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  47.13 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  46.88 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  46.54 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  41.14 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  41.48 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  35.64 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  36.96 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  38.66 
 
 		 219 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  39.52 
 
 		 724 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  42.94 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 735 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  38.98 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 729 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  38.61 
 
 		 651 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  38.61 
 
 		 651 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  38.61 
 
 		 651 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  39.74 
 
 		 748 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  38.61 
 
 		 651 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  38.61 
 
 		 651 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  38.61 
 
 		 651 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  38.61 
 
 		 651 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  38.61 
 
 		 651 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  39.76 
 
 		 166 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  39.74 
 
 		 654 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 650 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  37.01 
 
 		 798 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 		 730 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 607 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 650 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 650 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 650 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 650 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 		 731 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  40.76 
 
 		 603 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 650 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  35.37 
 
 		 730 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  39.18 
 
 		 830 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  36.31 
 
 		 833 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 763 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  39.29 
 
 		 763 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  35.8 
 
 		 800 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  40.62 
 
 		 709 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  40.4 
 
 		 690 aa  108  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  38.71 
 
 		 663 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  36.6 
 
 		 706 aa  105  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 		 715 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  36.81 
 
 		 777 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  39.61 
 
 		 709 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 735 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  36.31 
 
 		 663 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  35.29 
 
 		 739 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  39.61 
 
 		 719 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  36.65 
 
 		 782 aa  101  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 648 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  36.62 
 
 		 661 aa  99.8  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  42.68 
 
 		 664 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 		 671 aa  99.8  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  38.19 
 
 		 717 aa  99.4  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  34.39 
 
 		 660 aa  99  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  37.65 
 
 		 721 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  37.97 
 
 		 593 aa  98.2  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  35.76 
 
 		 644 aa  98.2  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  37.89 
 
 		 698 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 642 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  35.03 
 
 		 657 aa  97.1  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  35.03 
 
 		 657 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  32.69 
 
 		 720 aa  97.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  37.34 
 
 		 593 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  37.42 
 
 		 647 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  37.18 
 
 		 651 aa  95.5  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  32.48 
 
 		 693 aa  95.9  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  35.67 
 
 		 678 aa  95.5  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  34.84 
 
 		 637 aa  95.9  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  35.44 
 
 		 660 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  34.76 
 
 		 616 aa  95.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  40.14 
 
 		 661 aa  95.1  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  34.18 
 
 		 655 aa  94.4  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  36.94 
 
 		 750 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  36.94 
 
 		 750 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  34.18 
 
 		 655 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  34.39 
 
 		 659 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  34.81 
 
 		 653 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 		 641 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 		 641 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 		 641 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  32.91 
 
 		 650 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.16 
 
 		 641 aa  92.8  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  36.31 
 
 		 643 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  34.16 
 
 		 653 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  38.36 
 
 		 649 aa  92.8  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 		 657 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  36.94 
 
 		 750 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 641 aa  92  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>