More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1550 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 413 aa  812    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.51 
 
 		 435 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  32.28 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  30.12 
 
 		 431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  30.63 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.95 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.74 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.22 
 
 		 387 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.59 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  26.7 
 
 		 421 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.38 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.42 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.5 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.79 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.83 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  24.58 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  23.33 
 
 		 360 aa  97.4  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 		 457 aa  96.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.05 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  23.96 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.31 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.28 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  24.59 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  27.84 
 
 		 405 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  26.6 
 
 		 607 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.2 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 445 aa  94.4  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  21.71 
 
 		 363 aa  93.6  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.34 
 
 		 360 aa  92.8  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.6 
 
 		 481 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 		 363 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.72 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3787  RND family efflux transporter MFP subunit  26.72 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  24.8 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.21 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.42 
 
 		 453 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.45 
 
 		 478 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  29.1 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.17 
 
 		 361 aa  90.5  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.32 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5050  RND family efflux transporter MFP subunit  25.31 
 
 		 394 aa  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.38 
 
 		 398 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4937  efflux system, periplasmic component  25.12 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.58 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.76 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  25.86 
 
 		 379 aa  88.2  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  24.31 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  26.32 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  22.72 
 
 		 417 aa  87  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0478  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.1 
 
 		 395 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.6 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5428  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 397 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.73 
 
 		 349 aa  86.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5106  RND family efflux transporter MFP subunit  24.88 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4952  efflux system, periplasmic component  24.88 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5497  RND family efflux transporter MFP subunit  24.88 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  23.9 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  23.85 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  28.04 
 
 		 621 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  30.04 
 
 		 641 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  29.29 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  24.86 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  25.44 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  23.8 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  24.81 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  24.81 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  24.81 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  24.81 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1666  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5374  RND family efflux transporter MFP subunit  24.63 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  26.43 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  24.62 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.35 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.75 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.56 
 
 		 663 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  28.18 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.14 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.96 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.77 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  23.35 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.75 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  23.95 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  32.75 
 
 		 598 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  23.88 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  32.96 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  24.36 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1669  RND family efflux transporter MFP subunit  26 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  24.36 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.82 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>