More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0123 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
352 aa  717    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  51.46 
 
 
242 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  44.33 
 
 
262 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  43.75 
 
 
542 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  40.58 
 
 
251 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  41.75 
 
 
264 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  42.33 
 
 
417 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  38.74 
 
 
373 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  41.05 
 
 
258 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 
292 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  40.1 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  39.61 
 
 
488 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 
503 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  40.96 
 
 
275 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  41.98 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  40.96 
 
 
275 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  42.05 
 
 
267 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  39.68 
 
 
279 aa  132  6.999999999999999e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 
276 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 
275 aa  132  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  40.96 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  40.96 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  40.96 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  40.96 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 
537 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  38.76 
 
 
273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  37.11 
 
 
405 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  40.1 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 
263 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  40.85 
 
 
301 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  39.89 
 
 
275 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  39.36 
 
 
324 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  40.53 
 
 
465 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  39.5 
 
 
317 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 
204 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  40.96 
 
 
413 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  37.19 
 
 
520 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  36.87 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  40.1 
 
 
244 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  37.61 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 
238 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 
522 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35.2 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 
273 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2833  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120678  hitchhiker  0.0000000454714 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09380  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AQQ0]  35.68 
 
 
237 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124183 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  42.07 
 
 
217 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  37.78 
 
 
256 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  37.88 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
353 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  35 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  34.43 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  35.53 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  41.86 
 
 
199 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  41.99 
 
 
227 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  36.46 
 
 
258 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.55 
 
 
1115 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
291 aa  116  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
273 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
247 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  36.87 
 
 
263 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  36.04 
 
 
1115 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.04 
 
 
1115 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  37.16 
 
 
229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  36.04 
 
 
1119 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  45.8 
 
 
212 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  38.74 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.91 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  36.55 
 
 
204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  32.07 
 
 
241 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  37 
 
 
261 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.77 
 
 
241 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
871 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  36.04 
 
 
1115 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1016  polysaccharide deacetylase  35.45 
 
 
294 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5592  polysaccharide deacetylase  34.05 
 
 
272 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.18 
 
 
927 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 
327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  42.96 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
213 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  40.8 
 
 
232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
213 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 
220 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
213 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  35.18 
 
 
872 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
275 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2734  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
275 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000154127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2685  peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase  33.15 
 
 
275 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 
302 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
213 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2944  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
275 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000517931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2943  polysaccharide deacetylase  33.15 
 
 
275 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.02279e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>