More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2922 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2922  shikimate kinase II  100 
 
 		 173 aa  353  7.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3113  shikimate kinase II  79.19 
 
 		 173 aa  281  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.907983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0997  shikimate kinase II  69.36 
 
 		 173 aa  248  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.287041  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3313  shikimate kinase II  68.21 
 
 		 173 aa  247  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3282  shikimate kinase II  66.67 
 
 		 174 aa  224  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3143  shikimate kinase II  66.67 
 
 		 174 aa  224  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.770724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3293  shikimate kinase II  66.07 
 
 		 174 aa  224  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.431512  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2174  shikimate kinase II  62.79 
 
 		 172 aa  222  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2361  shikimate kinase II  63.37 
 
 		 175 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.314592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1018  shikimate kinase II  62.72 
 
 		 174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.891294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0859  shikimate kinase II  58.96 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0444  shikimate kinase II  57.14 
 
 		 181 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.647174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0425  shikimate kinase II  57.14 
 
 		 181 aa  207  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0431  shikimate kinase II  57.14 
 
 		 181 aa  207  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0486  shikimate kinase II  57.14 
 
 		 181 aa  207  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0426  shikimate kinase II  56.55 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal  0.531253 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00335  shikimate kinase II  55.29 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3220  Shikimate kinase  55.29 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0415  shikimate kinase II  55.29 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0456  shikimate kinase II  55.29 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0462  shikimate kinase II  55.29 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00339  hypothetical protein  55.29 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3244  shikimate kinase II  55.29 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0812303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0418  shikimate kinase II  55.29 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0305  shikimate kinase II  54.71 
 
 		 174 aa  195  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1776  shikimate kinase II  52.98 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.769228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2181  Shikimate kinase  54.39 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1410  Shikimate kinase  51.52 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2728  shikimate kinase II  47.88 
 
 		 180 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1381  Shikimate kinase  40.85 
 
 		 188 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1377  Shikimate kinase  43.29 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.149071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2092  shikimate kinase II  41.82 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300334  normal  0.0606791 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  40.94 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1388  Shikimate kinase  41.88 
 
 		 229 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00592582  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38.55 
 
 		 539 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  38.46 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  34.91 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  37.35 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  33.33 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  36.75 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0768  Shikimate kinase  45.6 
 
 		 177 aa  103  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  36.26 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  37.2 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  37.06 
 
 		 170 aa  101  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  34.76 
 
 		 190 aa  100  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  35.09 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  34.83 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  40.4 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  38.46 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  36.18 
 
 		 462 aa  99  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3659  Shikimate kinase  39.6 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  35.03 
 
 		 188 aa  98.2  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  34.76 
 
 		 187 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  34.76 
 
 		 187 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  33.93 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  33.93 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  36.71 
 
 		 161 aa  98.2  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  36.31 
 
 		 168 aa  97.4  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  35.98 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  33.33 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  36.75 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0086  Shikimate kinase  35.44 
 
 		 161 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.744352  hitchhiker  0.00173966 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  35.12 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  37.13 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  34.52 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  33.93 
 
 		 184 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  34.71 
 
 		 169 aa  94.7  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  33.54 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  38.85 
 
 		 192 aa  94.4  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  33.33 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  32.14 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  33.95 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  32.14 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  33.93 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  32.14 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  31.55 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  31.33 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  31.33 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  33.93 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  31.55 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  33.93 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  35.15 
 
 		 199 aa  91.7  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  31.33 
 
 		 454 aa  91.7  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  31.76 
 
 		 168 aa  91.3  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  31.03 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  34.15 
 
 		 181 aa  90.9  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  35.76 
 
 		 191 aa  90.9  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1039  Shikimate kinase  33.12 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0118821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  32.54 
 
 		 175 aa  90.5  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0124  shikimate kinase  33.33 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.529652  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2605  shikimate 5-dehydrogenase  35.4 
 
 		 457 aa  90.5  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  33.33 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  36.25 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  36.31 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  36.25 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  32.35 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  33.93 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  36.84 
 
 		 229 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1593  shikimate kinase  34.27 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  34.76 
 
 		 180 aa  88.2  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>