More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2920 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2920  porin  100 
 
 		 342 aa  696    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  57.23 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  56.56 
 
 		 340 aa  359  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  44.14 
 
 		 351 aa  245  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  41.71 
 
 		 359 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  44.21 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  43.5 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  44.21 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  43.5 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  41.42 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  40.06 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  38.9 
 
 		 361 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  39.35 
 
 		 358 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  40 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  40.66 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  37.86 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  40.66 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  39.47 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  40.66 
 
 		 387 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  39.76 
 
 		 358 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  39.76 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  39.4 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  39.4 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  39.4 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  37.28 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  38.97 
 
 		 363 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  38.62 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  37.98 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  37.98 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  38.44 
 
 		 360 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  38.6 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  38.6 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  41.97 
 
 		 332 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  38.02 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  36.9 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  37.61 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  36.61 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  36.87 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  34.21 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  36.99 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  34.66 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  36.66 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  36.75 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  35.15 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  34.45 
 
 		 338 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  35.71 
 
 		 362 aa  135  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  35.96 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  32.79 
 
 		 352 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  34.05 
 
 		 362 aa  132  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  33.62 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  32.49 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  33.51 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  32.18 
 
 		 360 aa  126  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  35.74 
 
 		 344 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  34.76 
 
 		 368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  31.8 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  31.87 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  32.22 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  34.02 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  31.62 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  31.62 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  31.95 
 
 		 349 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  31.36 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  31.79 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  31.25 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  31.79 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  32.42 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  32.45 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  31.25 
 
 		 383 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  31.61 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  31.61 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.1 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  31.31 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  31.68 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  29.3 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  29.82 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  30.43 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  30.43 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  30.43 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  30.43 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  32.72 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  30.43 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  30.43 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1936  OmpC family outer membrane porin  31.25 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000467885  normal  0.0609572 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  28.95 
 
 		 358 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  30.16 
 
 		 436 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  29.23 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  30.16 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  30.4 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  29.71 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  27.87 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4558  porin  32 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0171  porin  28.86 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  31.65 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  32.08 
 
 		 358 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  31.84 
 
 		 387 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  29.7 
 
 		 351 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  29.09 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  29.09 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  30.33 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>