More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0024 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0024  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
246 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0026  diguanylate phosphodiesterase  99.59 
 
 
246 aa  507  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1408  diguanylate phosphodiesterase  52.17 
 
 
332 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  49.79 
 
 
254 aa  258  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0264  diguanylate phosphodiesterase  51.27 
 
 
259 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0236  EAL domain protein  51.69 
 
 
260 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0525  diguanylate phosphodiesterase  49.37 
 
 
251 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  48.72 
 
 
256 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0171  EAL  50.42 
 
 
260 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3107  diguanylate phosphodiesterase  50.63 
 
 
259 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.757565  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3232  diguanylate phosphodiesterase  47.46 
 
 
266 aa  244  1e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72536  normal  0.33635 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1747  diguanylate phosphodiesterase  49 
 
 
291 aa  241  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.087315  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2934  diguanylate phosphodiesterase  48.32 
 
 
252 aa  241  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.780718  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1584  diguanylate phosphodiesterase  47.26 
 
 
263 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0237519  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2208  diguanylate phosphodiesterase  47.03 
 
 
254 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3242  EAL domain-containing protein  46.06 
 
 
283 aa  234  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0028  diguanylate phosphodiesterase  46.89 
 
 
255 aa  234  1e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3566  diguanylate phosphodiesterase  46.06 
 
 
265 aa  233  2e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1247  hypothetical protein  47.48 
 
 
257 aa  233  2e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.26257e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0914  EAL domain-containing protein  48.1 
 
 
256 aa  232  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0005  diguanylate phosphodiesterase  43.6 
 
 
259 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162907  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  46.15 
 
 
249 aa  231  7e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0806  signal protein  44.77 
 
 
257 aa  231  7e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0637  hypothetical protein  43.7 
 
 
257 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00815017  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2731  putative diguanylate phosphodiesterase  49.14 
 
 
259 aa  229  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3438  diguanylate phosphodiesterase  43.98 
 
 
265 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2830  diguanylate phosphodiesterase  44.03 
 
 
253 aa  228  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1233  diguanylate phosphodiesterase  46.61 
 
 
258 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1172  diguanylate phosphodiesterase  46.19 
 
 
258 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2810  diguanylate phosphodiesterase  47.79 
 
 
257 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0601  diguanylate phosphodiesterase  48.28 
 
 
258 aa  218  8e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0519  diguanylate phosphodiesterase  47.84 
 
 
257 aa  218  9e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3798  diguanylate phosphodiesterase  47.41 
 
 
257 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0545  diguanylate phosphodiesterase  47.41 
 
 
257 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0541  diguanylate phosphodiesterase  47.41 
 
 
257 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1902  diguanylate phosphodiesterase  45.38 
 
 
253 aa  213  3e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.570063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0792  diguanylate phosphodiesterase  48.39 
 
 
224 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0883  diguanylate phosphodiesterase  41.92 
 
 
262 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1965  diguanylate phosphodiesterase  38.72 
 
 
248 aa  194  8e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2342  diguanylate phosphodiesterase  41.87 
 
 
257 aa  179  5e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  38.39 
 
 
239 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  36.12 
 
 
390 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1138  diguanylate phosphodiesterase  36.28 
 
 
266 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  37.73 
 
 
356 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  36.16 
 
 
352 aa  155  5e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  35.81 
 
 
351 aa  152  3e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  35.45 
 
 
367 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 
340 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.22 
 
 
753 aa  144  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  36.56 
 
 
371 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.08 
 
 
766 aa  142  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  36.44 
 
 
362 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  36.44 
 
 
360 aa  141  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  34.25 
 
 
734 aa  140  2e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.65 
 
 
632 aa  139  4e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  35.84 
 
 
406 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.62 
 
 
773 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.43 
 
 
883 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0058  diguanylate phosphodiesterase  33.93 
 
 
357 aa  135  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.6 
 
 
786 aa  134  1e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.62 
 
 
797 aa  134  1e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.44 
 
 
581 aa  129  5e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1514  diguanylate phosphodiesterase  32 
 
 
437 aa  127  1e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000323461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.58 
 
 
590 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.77 
 
 
633 aa  126  4e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.67 
 
 
580 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  29.95 
 
 
592 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.17 
 
 
585 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  8.68734e-06  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.17 
 
 
585 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.17 
 
 
585 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.17 
 
 
585 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.37032e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.7 
 
 
611 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  28.83 
 
 
306 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1757  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 
418 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388257  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  28.83 
 
 
379 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.03 
 
 
584 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.7 
 
 
572 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.19 
 
 
583 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  28.83 
 
 
357 aa  121  1e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  31.56 
 
 
584 aa  121  1e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.19 
 
 
583 aa  121  1e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.7 
 
 
584 aa  119  4e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.58 
 
 
584 aa  119  5e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3107  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.36 
 
 
610 aa  118  8e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.73 
 
 
605 aa  117  1e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2453  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.36 
 
 
633 aa  118  1e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.04 
 
 
806 aa  117  2e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844108  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.49 
 
 
590 aa  117  2e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1402  diguanylate phosphodiesterase  30.45 
 
 
372 aa  117  2e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.281797  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  31.25 
 
 
584 aa  117  2e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.03 
 
 
596 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  28.03 
 
 
590 aa  115  4e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4854  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.22 
 
 
594 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3777  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.22 
 
 
594 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  29.78 
 
 
284 aa  113  2e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01138  predicted FAD-binding phosphodiesterase  30.21 
 
 
403 aa  114  2e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01146  hypothetical protein  30.21 
 
 
403 aa  114  2e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  30.28 
 
 
475 aa  114  2e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1259  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  30.21 
 
 
403 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2463  diguanylate phosphodiesterase  30.21 
 
 
403 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>