107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6558 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.74 
 
 		 688 aa  743    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 687 aa  1433    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  45.95 
 
 		 690 aa  614  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  45.09 
 
 		 704 aa  608  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.93 
 
 		 698 aa  602  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.79 
 
 		 704 aa  529  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.93 
 
 		 709 aa  451  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  47.86 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  40.56 
 
 		 932 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  40.32 
 
 		 750 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  45.04 
 
 		 606 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.04 
 
 		 487 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  34.14 
 
 		 638 aa  363  6e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  42.25 
 
 		 581 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  40 
 
 		 470 aa  350  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  35.64 
 
 		 460 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  35.59 
 
 		 460 aa  284  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  39.7 
 
 		 410 aa  249  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  33.84 
 
 		 434 aa  247  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  26.64 
 
 		 436 aa  158  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  26.19 
 
 		 436 aa  157  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.24 
 
 		 1289 aa  127  8.000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.37 
 
 		 467 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  31.37 
 
 		 581 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  34.17 
 
 		 435 aa  118  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  27.06 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  28.44 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.55 
 
 		 1329 aa  100  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  28.66 
 
 		 435 aa  98.6  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  29.55 
 
 		 674 aa  97.4  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  28.47 
 
 		 441 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.34 
 
 		 1264 aa  95.5  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  26.54 
 
 		 711 aa  93.2  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  43.06 
 
 		 805 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  34.27 
 
 		 478 aa  92.8  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  24.38 
 
 		 473 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  26.59 
 
 		 429 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  26.59 
 
 		 450 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  27.87 
 
 		 447 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  27.11 
 
 		 474 aa  89.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  26.1 
 
 		 473 aa  87.4  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  22.53 
 
 		 538 aa  83.2  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  25.57 
 
 		 340 aa  84  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  24.09 
 
 		 471 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  27.05 
 
 		 431 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  24.61 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  40.88 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  27.22 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  36.5 
 
 		 627 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  26.29 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  30.43 
 
 		 596 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  32.87 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  27.76 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  27.36 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  30.56 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  26.62 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  44.87 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  28.23 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  43.59 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0992  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.31 
 
 		 1056 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  26.22 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  24.35 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  29.45 
 
 		 644 aa  64.3  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  34.21 
 
 		 1965 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  24.35 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  34.71 
 
 		 2095 aa  62  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  28.73 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.37 
 
 		 1967 aa  60.8  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  38 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  24.82 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  25.16 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  26.86 
 
 		 537 aa  58.9  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  33.88 
 
 		 2095 aa  58.9  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  32.32 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  25.17 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  35 
 
 		 1471 aa  58.2  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  24.3 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  30 
 
 		 850 aa  57.4  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  24.67 
 
 		 505 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  26.52 
 
 		 1108 aa  56.6  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  40.23 
 
 		 606 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  34.57 
 
 		 780 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  27.49 
 
 		 1001 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  26.23 
 
 		 591 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  31 
 
 		 600 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  36.49 
 
 		 478 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  30.23 
 
 		 557 aa  52  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  41.82 
 
 		 212 aa  51.2  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  26.07 
 
 		 464 aa  51.2  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.51 
 
 		 558 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.16 
 
 		 1781 aa  50.8  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  36.9 
 
 		 473 aa  50.8  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  25.18 
 
 		 492 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  38.46 
 
 		 731 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  28.78 
 
 		 1588 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  39.77 
 
 		 474 aa  48.5  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  29.13 
 
 		 515 aa  48.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  41.27 
 
 		 551 aa  48.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  31.03 
 
 		 466 aa  48.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  37.88 
 
 		 652 aa  47.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>