More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1798 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 606 aa  1195    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  60.5 
 
 		 714 aa  651    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  56.59 
 
 		 670 aa  615  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  58.32 
 
 		 620 aa  608  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  57.09 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  50.58 
 
 		 585 aa  521  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  51.67 
 
 		 585 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  53.15 
 
 		 620 aa  491  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  47.76 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  44.7 
 
 		 640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  55.05 
 
 		 684 aa  432  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  42.23 
 
 		 581 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  45.44 
 
 		 584 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  46.37 
 
 		 547 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  41.17 
 
 		 564 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  41.2 
 
 		 607 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  46.46 
 
 		 674 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  42.94 
 
 		 566 aa  332  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  45.52 
 
 		 680 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  38.34 
 
 		 550 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  40.61 
 
 		 538 aa  301  2e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  50 
 
 		 603 aa  293  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  36.12 
 
 		 632 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  47.59 
 
 		 617 aa  261  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  39.89 
 
 		 656 aa  260  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  38.22 
 
 		 653 aa  253  9.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  36.03 
 
 		 573 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  44.41 
 
 		 599 aa  250  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  40.88 
 
 		 666 aa  249  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  48.71 
 
 		 649 aa  249  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  34.11 
 
 		 496 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  41.8 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  41.8 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  41.8 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 989 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  30.51 
 
 		 489 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  32.45 
 
 		 457 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  30.1 
 
 		 487 aa  180  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  29.86 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  31.39 
 
 		 495 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  30.66 
 
 		 489 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  30.33 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.47 
 
 		 911 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  39.38 
 
 		 461 aa  168  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  33.93 
 
 		 534 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  29.01 
 
 		 885 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  32.86 
 
 		 533 aa  165  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  38.28 
 
 		 900 aa  164  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  32.23 
 
 		 532 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.4 
 
 		 848 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  29.84 
 
 		 495 aa  162  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  30.85 
 
 		 605 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  37.5 
 
 		 977 aa  160  7e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  33.73 
 
 		 533 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  31.44 
 
 		 622 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  29.26 
 
 		 619 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  32.54 
 
 		 533 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  36.04 
 
 		 403 aa  159  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.83 
 
 		 849 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  30.04 
 
 		 1001 aa  157  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  39 
 
 		 533 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  29.86 
 
 		 489 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  39.33 
 
 		 533 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  28.93 
 
 		 594 aa  154  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  39.45 
 
 		 855 aa  154  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.86 
 
 		 853 aa  154  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  35.28 
 
 		 464 aa  153  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  32.31 
 
 		 735 aa  153  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  29.69 
 
 		 1029 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  31.52 
 
 		 594 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  35.63 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  31.52 
 
 		 594 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  30.1 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.5 
 
 		 995 aa  152  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  40.35 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  30.14 
 
 		 493 aa  151  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  32.72 
 
 		 531 aa  151  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  37.76 
 
 		 530 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  28.22 
 
 		 515 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  27.23 
 
 		 535 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  33.83 
 
 		 531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  28.01 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  32.97 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.17 
 
 		 991 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  33.71 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  36.01 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  33.71 
 
 		 419 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  27.41 
 
 		 496 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.26 
 
 		 856 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  33.7 
 
 		 441 aa  147  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  35.8 
 
 		 530 aa  147  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  37.55 
 
 		 532 aa  147  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.19 
 
 		 990 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  27.14 
 
 		 473 aa  146  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  34.69 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  37.14 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  34.98 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  33.45 
 
 		 470 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  36.12 
 
 		 535 aa  144  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  36.5 
 
 		 532 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>