84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1628 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 222 aa  421  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  43.5 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17160  2'-5' RNA ligase  42.2 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0177806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  32.14 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  33.62 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  37.78 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  42.99 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  34.88 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  36.44 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  32.29 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  33.18 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  28.81 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  34.98 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  34.64 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  26.62 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  37.41 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  32.62 
 
 		 185 aa  62  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  33.48 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  31.37 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  36.88 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  31.21 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  30.71 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  28.37 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  36.96 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  21.01 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  30.62 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  36.96 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  36.96 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  33.16 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  32.39 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  32.88 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  26.62 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  23.87 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  33.54 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  27.14 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 186 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  24.82 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  26.43 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  28.47 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  28.47 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 		 178 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  31.54 
 
 		 184 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.23 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  23.32 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  31.9 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0088  2',5' RNA ligase  34.41 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  36.45 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  31.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  29.29 
 
 		 177 aa  48.5  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  25.56 
 
 		 193 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  27.94 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 271 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  29.2 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  30.56 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  27.62 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  30.71 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0508  2'-5' RNA ligase  30.97 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170013  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  28.3 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  23.74 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  29.5 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 176 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  27.47 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 298 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  36.7 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  21.47 
 
 		 174 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  32.65 
 
 		 179 aa  45.1  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  25.9 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  29.63 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  36.28 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  31.88 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  22.86 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  35.24 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1029  2'-5' RNA ligase  32.14 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  26.26 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  29.2 
 
 		 207 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  27.88 
 
 		 178 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  27.54 
 
 		 173 aa  41.6  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  31.51 
 
 		 183 aa  41.6  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>