136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3322 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  100 
 
 
1210 aa  2490    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  32.19 
 
 
1184 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  31.98 
 
 
1154 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  28.7 
 
 
1159 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  27.32 
 
 
1089 aa  198  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  30.61 
 
 
1147 aa  174  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  25.14 
 
 
1132 aa  166  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  23.59 
 
 
1209 aa  165  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  27.71 
 
 
1178 aa  160  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  28.79 
 
 
1177 aa  159  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  28.57 
 
 
1120 aa  154  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  29.61 
 
 
1039 aa  153  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  27.87 
 
 
1076 aa  153  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  25.1 
 
 
1104 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  24.67 
 
 
1338 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  35.61 
 
 
1170 aa  127  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  24.02 
 
 
882 aa  122  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  25.85 
 
 
838 aa  111  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.74 
 
 
1257 aa  107  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  23.74 
 
 
1299 aa  106  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.14 
 
 
1298 aa  105  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  23.37 
 
 
1244 aa  103  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  24.48 
 
 
1088 aa  102  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 
694 aa  95.5  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  22.29 
 
 
1186 aa  94.4  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  21.02 
 
 
1252 aa  94  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  21.45 
 
 
1256 aa  93.6  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  24.32 
 
 
1343 aa  84.7  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25.78 
 
 
1422 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  25.28 
 
 
1339 aa  83.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  20.96 
 
 
1194 aa  80.9  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  25.05 
 
 
587 aa  77  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25.28 
 
 
1432 aa  76.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  24.18 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.84 
 
 
995 aa  73.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  24.57 
 
 
1338 aa  72.8  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  28.67 
 
 
1321 aa  71.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  22.71 
 
 
521 aa  71.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  33.1 
 
 
1036 aa  71.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  23.21 
 
 
554 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  24.46 
 
 
1243 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.25 
 
 
1041 aa  70.5  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  27.98 
 
 
974 aa  68.6  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  26.92 
 
 
1342 aa  68.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  25.36 
 
 
1346 aa  67.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  25 
 
 
1322 aa  67  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  25.37 
 
 
1452 aa  67  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  25.31 
 
 
1461 aa  66.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3860  putative vgr-related protein  25.44 
 
 
628 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  22.78 
 
 
1319 aa  65.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  24.6 
 
 
1055 aa  65.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  20.73 
 
 
533 aa  65.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  30.29 
 
 
1426 aa  65.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  25.09 
 
 
553 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  24.24 
 
 
1366 aa  64.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  23.32 
 
 
1318 aa  63.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  24.73 
 
 
1347 aa  63.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  22.09 
 
 
523 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  25.87 
 
 
552 aa  62.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  21.04 
 
 
1250 aa  62  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  23.28 
 
 
1336 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  22.08 
 
 
1250 aa  60.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  23.74 
 
 
1321 aa  59.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  25.17 
 
 
1363 aa  59.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3923  putative Vgr-related protein  25.86 
 
 
626 aa  59.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  28.64 
 
 
1333 aa  58.9  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  26.14 
 
 
1058 aa  59.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  24.13 
 
 
1354 aa  58.9  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  29.22 
 
 
1373 aa  58.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  32.17 
 
 
792 aa  58.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  28.42 
 
 
950 aa  58.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  28.3 
 
 
410 aa  58.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  22.94 
 
 
522 aa  58.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0176  type II restriction enzyme methylase subunits- like protein  23.04 
 
 
919 aa  58.5  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  23.57 
 
 
1306 aa  58.2  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  25.69 
 
 
539 aa  58.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3946  putative vgr-related protein  24.73 
 
 
628 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  26.23 
 
 
1441 aa  56.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  24.45 
 
 
1331 aa  56.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  24.1 
 
 
1347 aa  55.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.48 
 
 
1020 aa  55.5  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  24.65 
 
 
534 aa  55.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  21.96 
 
 
1358 aa  55.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0759  hypothetical protein  22.44 
 
 
912 aa  55.1  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.231322  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  24.13 
 
 
415 aa  54.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  27.22 
 
 
416 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  25.32 
 
 
518 aa  54.3  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  26.98 
 
 
562 aa  54.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  23.08 
 
 
1338 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  22.25 
 
 
1440 aa  53.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  23.76 
 
 
579 aa  53.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3520  hypothetical protein  27.64 
 
 
280 aa  53.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3803  putative Vgr-related protein  23.83 
 
 
628 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  25.2 
 
 
557 aa  52  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1465  hypothetical protein  22.44 
 
 
914 aa  51.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152551  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  23.2 
 
 
1098 aa  51.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  22.57 
 
 
1459 aa  50.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  24.78 
 
 
1442 aa  50.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  22.98 
 
 
1219 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  20.5 
 
 
1278 aa  50.1  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>