27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3803 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3803  putative Vgr-related protein  100 
 
 
628 aa  1123    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3860  putative vgr-related protein  93.15 
 
 
628 aa  800    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3946  putative vgr-related protein  93.31 
 
 
628 aa  781    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192424  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3923  putative Vgr-related protein  72.79 
 
 
626 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  27.82 
 
 
1210 aa  73.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  24.85 
 
 
1184 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  50.63 
 
 
680 aa  58.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  53.16 
 
 
673 aa  57.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  25.82 
 
 
554 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  29.17 
 
 
501 aa  54.3  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  29.17 
 
 
501 aa  54.3  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  46.84 
 
 
677 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  31.43 
 
 
579 aa  50.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  32.8 
 
 
552 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  23.33 
 
 
519 aa  47.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  34.52 
 
 
540 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  43.75 
 
 
698 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  34.52 
 
 
535 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  32.14 
 
 
532 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  31.65 
 
 
573 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  28.46 
 
 
528 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  30.95 
 
 
544 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0309  hypothetical protein  29.67 
 
 
691 aa  45.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  27.4 
 
 
595 aa  44.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  32.02 
 
 
816 aa  44.3  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  32.14 
 
 
517 aa  44.3  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.78 
 
 
549 aa  43.9  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.801077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>