27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3946 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3803  putative Vgr-related protein  93.31 
 
 		 628 aa  759    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3946  putative vgr-related protein  100 
 
 		 628 aa  1134    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3860  putative vgr-related protein  96.66 
 
 		 628 aa  844    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3923  putative Vgr-related protein  71.92 
 
 		 626 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1210 aa  73.9  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1184 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  27.99 
 
 		 554 aa  62  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  51.25 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  47.5 
 
 		 677 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  51.25 
 
 		 673 aa  54.7  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  29.17 
 
 		 501 aa  54.7  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  29.17 
 
 		 501 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  31.02 
 
 		 579 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  26.13 
 
 		 552 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  34.15 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  32.37 
 
 		 573 aa  48.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  29.27 
 
 		 528 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  48.15 
 
 		 698 aa  47.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  32.59 
 
 		 595 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  29.09 
 
 		 662 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  28.36 
 
 		 873 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  34.52 
 
 		 548 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  32.58 
 
 		 816 aa  45.8  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  34.44 
 
 		 508 aa  45.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2480  N-6 DNA methylase  44 
 
 		 587 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255725  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  36.67 
 
 		 466 aa  44.3  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  32.95 
 
 		 543 aa  44.3  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>