84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0493 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  100 
 
 		 532 aa  1083    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  53.49 
 
 		 176 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  22.87 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  23.08 
 
 		 461 aa  90.5  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  29.65 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  30.87 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  30.25 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  30.53 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  35 
 
 		 228 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  27.51 
 
 		 427 aa  62  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  25.57 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  38.37 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  27.98 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  44.16 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  26.49 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  29.63 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  28.3 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  28.03 
 
 		 422 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  29.66 
 
 		 251 aa  57  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  36.67 
 
 		 601 aa  57  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  38.71 
 
 		 582 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  32.43 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  37.5 
 
 		 540 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  38.96 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  44.59 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  41.33 
 
 		 450 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  33.91 
 
 		 408 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  38.96 
 
 		 446 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  42.86 
 
 		 448 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.98 
 
 		 429 aa  53.5  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  27.08 
 
 		 403 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  28.03 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  36.59 
 
 		 203 aa  53.5  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  43.33 
 
 		 284 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  35.56 
 
 		 443 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  36.71 
 
 		 455 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  27.85 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  35.14 
 
 		 619 aa  51.6  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  38.57 
 
 		 457 aa  50.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  23.27 
 
 		 410 aa  50.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  25.78 
 
 		 464 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  28 
 
 		 442 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  24.79 
 
 		 420 aa  50.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  28.87 
 
 		 712 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  31 
 
 		 709 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  41.82 
 
 		 285 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  27.27 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  34.91 
 
 		 597 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  26.39 
 
 		 533 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  27.96 
 
 		 409 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  29.93 
 
 		 540 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  26.87 
 
 		 509 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  33.33 
 
 		 484 aa  47.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  29 
 
 		 567 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  28.68 
 
 		 567 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  24.43 
 
 		 530 aa  47  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  24 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  36.49 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  29.17 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  35.71 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  33.67 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  25.53 
 
 		 588 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  35.06 
 
 		 464 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  44.23 
 
 		 250 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  35.53 
 
 		 591 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  36 
 
 		 976 aa  44.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  28.24 
 
 		 483 aa  45.1  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  35.09 
 
 		 642 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  27.18 
 
 		 645 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3567  OLD family ATP-dependent endonuclease-like protein  30.99 
 
 		 604 aa  45.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  26 
 
 		 571 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  28.43 
 
 		 418 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.33 
 
 		 652 aa  43.9  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  31.75 
 
 		 451 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  39.71 
 
 		 382 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  28 
 
 		 634 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  42.31 
 
 		 264 aa  43.5  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  35.21 
 
 		 562 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  28.87 
 
 		 448 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  30.56 
 
 		 506 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>