86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC05660 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  100 
 
 		 542 aa  1126    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  46.76 
 
 		 448 aa  348  2e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  46.36 
 
 		 470 aa  346  6e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  42.6 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  41.77 
 
 		 314 aa  223  9e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  26.52 
 
 		 348 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  26.8 
 
 		 330 aa  87.4  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  28.48 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  25.62 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  24.92 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  25.16 
 
 		 350 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  26.89 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  26.89 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  27.73 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  26.81 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  26.62 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  25.55 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.01 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  26.46 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  24.76 
 
 		 564 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  25.1 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  24.92 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.2 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  23.81 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  23.81 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.6 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  28.67 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  23.49 
 
 		 516 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  23.49 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  23.49 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.42 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  23.55 
 
 		 356 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  23.55 
 
 		 356 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  24.14 
 
 		 351 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  28.91 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  25.93 
 
 		 355 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  25.93 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  25.93 
 
 		 355 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  27.92 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.03 
 
 		 354 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  26.1 
 
 		 367 aa  55.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  25.09 
 
 		 354 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.32 
 
 		 350 aa  54.7  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  25.97 
 
 		 270 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  25.97 
 
 		 270 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  25.09 
 
 		 354 aa  54.7  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  27.64 
 
 		 298 aa  52.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  27.45 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.63 
 
 		 292 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  25.35 
 
 		 304 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  27.59 
 
 		 345 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  30.48 
 
 		 361 aa  50.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  34.67 
 
 		 300 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  40.32 
 
 		 281 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  41.94 
 
 		 279 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  23.66 
 
 		 380 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  26.4 
 
 		 293 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  42.19 
 
 		 286 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  24.17 
 
 		 340 aa  48.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  32.94 
 
 		 280 aa  47.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  31.85 
 
 		 289 aa  47.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  28.08 
 
 		 288 aa  47.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  22.83 
 
 		 310 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  27.09 
 
 		 345 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  40.32 
 
 		 278 aa  47  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  30.83 
 
 		 279 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  40.32 
 
 		 280 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  37.1 
 
 		 279 aa  46.2  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  37.66 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  35.21 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  36.84 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  37.1 
 
 		 279 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  29.55 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  35.21 
 
 		 281 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  37.18 
 
 		 279 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  42.42 
 
 		 287 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  24.12 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 279 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0064  phytoene/squalene synthetase  33.33 
 
 		 236 aa  44.7  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  35.8 
 
 		 294 aa  43.9  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  30.83 
 
 		 278 aa  44.3  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  28.32 
 
 		 333 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  30.21 
 
 		 309 aa  43.9  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  29.27 
 
 		 309 aa  43.5  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.43 
 
 		 287 aa  43.5  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4554  squalene synthase HpnD  32.88 
 
 		 282 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124742  normal  0.209496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>