More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12568 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  100 
 
 		 762 aa  1535    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  38.81 
 
 		 696 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 770 aa  253  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 780 aa  237  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 680 aa  210  9e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 688 aa  207  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 682 aa  197  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 703 aa  190  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 680 aa  147  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 688 aa  146  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  22.75 
 
 		 690 aa  146  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 731 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 694 aa  137  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  21.83 
 
 		 728 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  22.89 
 
 		 706 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  22.61 
 
 		 706 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  22.47 
 
 		 706 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  22.61 
 
 		 706 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  22.6 
 
 		 721 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 715 aa  130  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  22.81 
 
 		 681 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  22.56 
 
 		 701 aa  124  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 700 aa  124  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  22.6 
 
 		 691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 706 aa  122  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 742 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 700 aa  121  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 700 aa  121  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 700 aa  121  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  21.87 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  21.87 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  21.4 
 
 		 700 aa  118  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 701 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  21.66 
 
 		 675 aa  117  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  21.74 
 
 		 705 aa  117  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 700 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 678 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 681 aa  111  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 705 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 709 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.61 
 
 		 712 aa  108  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  22.28 
 
 		 710 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 723 aa  104  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 706 aa  103  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 702 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 698 aa  99  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 713 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 697 aa  96.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 715 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 678 aa  94.7  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 717 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 706 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 700 aa  92.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 736 aa  91.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  20.93 
 
 		 723 aa  91.3  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 726 aa  91.3  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 716 aa  89  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 779 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 720 aa  87.8  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  21.2 
 
 		 743 aa  86.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  23.75 
 
 		 808 aa  85.5  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 		 703 aa  84  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  22.5 
 
 		 797 aa  84  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  19.23 
 
 		 757 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 718 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  21.01 
 
 		 736 aa  80.1  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 735 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  21.41 
 
 		 742 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 748 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 757 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.52 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 681 aa  78.2  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  20.74 
 
 		 712 aa  77.4  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 729 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  20.68 
 
 		 730 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.83 
 
 		 713 aa  75.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  19.97 
 
 		 740 aa  74.7  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 698 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  23.99 
 
 		 712 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  22.01 
 
 		 690 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  24.09 
 
 		 715 aa  73.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.96 
 
 		 666 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 687 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 737 aa  71.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 690 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  19.03 
 
 		 736 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 705 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  24.81 
 
 		 666 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  24.81 
 
 		 666 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  21.55 
 
 		 733 aa  70.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  21.39 
 
 		 739 aa  70.5  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 686 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  21.74 
 
 		 777 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  20.91 
 
 		 800 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 722 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  20.67 
 
 		 704 aa  68.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  20.73 
 
 		 700 aa  68.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  21.94 
 
 		 699 aa  68.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>