More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05100 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  100 
 
 		 762 aa  1575    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  31.21 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  30.44 
 
 		 511 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  27.7 
 
 		 588 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  31.18 
 
 		 484 aa  167  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  28.54 
 
 		 574 aa  163  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  25.92 
 
 		 528 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  25.7 
 
 		 528 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  25.75 
 
 		 589 aa  147  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  26.55 
 
 		 885 aa  144  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  27.02 
 
 		 622 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  25.67 
 
 		 610 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  27.27 
 
 		 589 aa  142  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  25.78 
 
 		 584 aa  141  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  26.23 
 
 		 622 aa  139  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  24.13 
 
 		 533 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  26.12 
 
 		 586 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  25.91 
 
 		 610 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26.27 
 
 		 586 aa  137  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  28.76 
 
 		 477 aa  137  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 		 838 aa  136  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.75 
 
 		 610 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  25.97 
 
 		 472 aa  135  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  25.92 
 
 		 739 aa  135  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  23.95 
 
 		 703 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26.24 
 
 		 586 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  25.81 
 
 		 586 aa  134  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  25.81 
 
 		 586 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  25.78 
 
 		 586 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  25.81 
 
 		 586 aa  134  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  25.81 
 
 		 586 aa  134  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  25.81 
 
 		 586 aa  134  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  26.44 
 
 		 586 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  25.93 
 
 		 836 aa  130  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  26.39 
 
 		 574 aa  130  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  29.13 
 
 		 1005 aa  130  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.83 
 
 		 524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  25.97 
 
 		 481 aa  129  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.7 
 
 		 586 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  26.12 
 
 		 1021 aa  129  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.57 
 
 		 582 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  24.49 
 
 		 663 aa  127  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  26.58 
 
 		 586 aa  127  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  25.86 
 
 		 814 aa  127  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  27.01 
 
 		 564 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  25.54 
 
 		 599 aa  126  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  23.52 
 
 		 614 aa  125  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  26.29 
 
 		 490 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  27.35 
 
 		 526 aa  124  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.53 
 
 		 462 aa  121  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  23.89 
 
 		 488 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  24.56 
 
 		 604 aa  121  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 		 635 aa  120  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  24.2 
 
 		 639 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  26.72 
 
 		 2638 aa  120  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.16 
 
 		 1891 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 630 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  25.78 
 
 		 619 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  27.33 
 
 		 566 aa  118  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  24.76 
 
 		 459 aa  118  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 587 aa  117  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  25.77 
 
 		 741 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  26.7 
 
 		 752 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.9 
 
 		 481 aa  115  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.06 
 
 		 2068 aa  114  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  24.6 
 
 		 742 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  24.55 
 
 		 593 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  25.7 
 
 		 576 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  24.7 
 
 		 767 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  22.46 
 
 		 631 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  24.89 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  26.15 
 
 		 620 aa  112  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  23.22 
 
 		 623 aa  112  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  23.51 
 
 		 575 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  24.81 
 
 		 914 aa  111  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  25.29 
 
 		 609 aa  110  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  24.71 
 
 		 583 aa  110  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  24.33 
 
 		 487 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  23.12 
 
 		 496 aa  109  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04824  glycosidease  26.44 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  24.91 
 
 		 815 aa  108  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  26.03 
 
 		 642 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  24.51 
 
 		 532 aa  108  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.22 
 
 		 1942 aa  108  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  23.14 
 
 		 558 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  25.13 
 
 		 654 aa  107  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  25.78 
 
 		 515 aa  107  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  25.83 
 
 		 623 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  24.84 
 
 		 1847 aa  106  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  26.41 
 
 		 473 aa  105  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  25.46 
 
 		 578 aa  105  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  26.41 
 
 		 473 aa  105  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  22.48 
 
 		 1307 aa  105  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001087  glycosidase  27.11 
 
 		 537 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  25.33 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  25.33 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  23.85 
 
 		 765 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  42.11 
 
 		 686 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  21.6 
 
 		 715 aa  103  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  23.9 
 
 		 774 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>