More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4632 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  100 
 
 		 368 aa  731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  48.31 
 
 		 357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  47.47 
 
 		 357 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  46.91 
 
 		 357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  46.13 
 
 		 397 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  46.13 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  46.13 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  46.13 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  46.13 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  46.13 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  45.95 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  45.11 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  44.67 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  43.77 
 
 		 359 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  43.77 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  42.86 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  42.86 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  43.8 
 
 		 359 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  43.39 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  44.51 
 
 		 373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  40.95 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  39.4 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  39.4 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  37.11 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  36.74 
 
 		 361 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  37.5 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  36.69 
 
 		 360 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  36.51 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2524  OmpC family outer membrane porin  34.44 
 
 		 362 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.104939 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  38.34 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  38.34 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  38.34 
 
 		 375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  38.24 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  35.34 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  35.71 
 
 		 381 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  35.11 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  36.72 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  37.86 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  34.29 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  37.16 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  36.29 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  33.59 
 
 		 391 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  36.75 
 
 		 380 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  35.56 
 
 		 387 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  33.08 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  33.08 
 
 		 409 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  36.01 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  35.43 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  36.01 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  35.49 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  36.89 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  36.89 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  37.16 
 
 		 379 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  35.49 
 
 		 384 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.27 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  34.86 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  36.04 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  33.16 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  37.4 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  35.03 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  34.44 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  34.44 
 
 		 384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  35.43 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  34.79 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  32 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  35.74 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  34.79 
 
 		 380 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  34.44 
 
 		 384 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  36.78 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  34.18 
 
 		 384 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  34.26 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  34.26 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  34.18 
 
 		 384 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  34.18 
 
 		 384 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  36.09 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  36.71 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  33.66 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5151  porin  35.26 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  37.16 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  33.66 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  35.61 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  35.47 
 
 		 389 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  34.16 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  35.77 
 
 		 386 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  33.66 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  33.66 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  34.65 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  33.76 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4625  porin  35.26 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0866781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  35.12 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  34.22 
 
 		 381 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  35.11 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  34.17 
 
 		 384 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  34.79 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  34.38 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  33.77 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  36.68 
 
 		 411 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  33.77 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  33.59 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  33.5 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>