More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1094 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  100 
 
 
230 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  61.74 
 
 
230 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  56.47 
 
 
231 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  57.64 
 
 
242 aa  257  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  49.57 
 
 
230 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  50 
 
 
229 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  48.7 
 
 
229 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  43.91 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  42.61 
 
 
242 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  43.04 
 
 
243 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  41.3 
 
 
243 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  42.17 
 
 
243 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  44.98 
 
 
241 aa  185  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  40.87 
 
 
242 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  43.67 
 
 
228 aa  180  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  41.67 
 
 
243 aa  179  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  44.84 
 
 
231 aa  178  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  42.15 
 
 
226 aa  174  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  40.27 
 
 
249 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  40.36 
 
 
226 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  40.95 
 
 
246 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  39.11 
 
 
246 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  38.01 
 
 
223 aa  151  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  43.41 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  39.66 
 
 
247 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  39.63 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  33.63 
 
 
233 aa  124  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  35.87 
 
 
236 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  37.93 
 
 
217 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  31.44 
 
 
231 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  38.12 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  37.29 
 
 
339 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  39.73 
 
 
147 aa  111  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  46.85 
 
 
333 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  40.62 
 
 
348 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  38.78 
 
 
339 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.67 
 
 
338 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  36.73 
 
 
149 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  38.93 
 
 
153 aa  99.8  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  34.46 
 
 
152 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  38.1 
 
 
153 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  38.36 
 
 
332 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  36.94 
 
 
330 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  36.84 
 
 
154 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  35.23 
 
 
193 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  37.06 
 
 
149 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  36.55 
 
 
155 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  34.69 
 
 
149 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  35.86 
 
 
132 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 
152 aa  91.7  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  35.94 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  38.36 
 
 
153 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 
150 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  36.91 
 
 
152 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  35.4 
 
 
154 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  34.46 
 
 
149 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  35.44 
 
 
154 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 
149 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
149 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  34.29 
 
 
155 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  35.53 
 
 
150 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  34.23 
 
 
151 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 
120 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
150 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  30.67 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  33.18 
 
 
228 aa  85.1  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
152 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.56 
 
 
154 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  40.69 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  29.65 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 
150 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  30.13 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  34.36 
 
 
164 aa  80.9  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.04 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  33.11 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  29.61 
 
 
428 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.76 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  33.33 
 
 
213 aa  79  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  29.26 
 
 
232 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  35.86 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 
149 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  34.25 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  34.25 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.99 
 
 
158 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  33.33 
 
 
132 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  36.55 
 
 
155 aa  78.2  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  32.87 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  35.62 
 
 
154 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  34.93 
 
 
427 aa  75.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  34.75 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  34.25 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  31.96 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  30.77 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  34.51 
 
 
862 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  31.05 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.99 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  32.48 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  29.65 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.12 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>