More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0161 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  78.69 
 
 		 306 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  77.38 
 
 		 306 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  53 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  53.33 
 
 		 309 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  54.24 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  51.9 
 
 		 319 aa  296  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  51.74 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  54.61 
 
 		 317 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  53.18 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  48.84 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  54.44 
 
 		 306 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  53.91 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  56.38 
 
 		 308 aa  252  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  55.97 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  50.6 
 
 		 319 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  46.97 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  49.19 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  49.61 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  47.54 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  32.26 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  37.07 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  29.7 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  26.06 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  25.63 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  27.85 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  29.45 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  24.02 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  24.15 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0123  beta-lactamase-like  27.32 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.998731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 399 aa  55.8  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.69 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  30.51 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  23.43 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  26.7 
 
 		 213 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  26.64 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  29.56 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  29.17 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 354 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 344 aa  53.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.29 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 333 aa  52.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  25.93 
 
 		 217 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  25.53 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  24.74 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  35.63 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.6 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  31.13 
 
 		 200 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0463  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 		 192 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00512512  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.81 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  27.49 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  29.22 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  24.37 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 		 211 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 365 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 204 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  26.74 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  33.12 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.91 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  29.03 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  27.64 
 
 		 354 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 321 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  25.39 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 220 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.67 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3586  metallo-beta-lactamase family protein  26.11 
 
 		 219 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 		 329 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.03 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 209 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0082  beta-lactamase domain protein  23.64 
 
 		 414 aa  50.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.143007  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>