More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1271 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  86.57 
 
 		 484 aa  714    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 484 aa  945    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  88.16 
 
 		 475 aa  747    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  86.79 
 
 		 485 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  88.16 
 
 		 475 aa  747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  86.79 
 
 		 485 aa  778    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  88.16 
 
 		 475 aa  747    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  67.74 
 
 		 480 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  64.36 
 
 		 461 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2404  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  62.99 
 
 		 465 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.47 
 
 		 523 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.28 
 
 		 541 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.39 
 
 		 501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.96 
 
 		 479 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.09 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.07 
 
 		 519 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.05 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.46 
 
 		 483 aa  253  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.67 
 
 		 485 aa  249  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.89 
 
 		 509 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.64 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
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NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.21 
 
 		 488 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.21 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 559 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.39 
 
 		 504 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.58 
 
 		 517 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
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NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.04 
 
 		 536 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
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NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 		 534 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
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NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.38 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 		 531 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
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NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 		 491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  36 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
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NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 		 463 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  32.72 
 
 		 540 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.56 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  29.37 
 
 		 436 aa  196  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  30.33 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.31 
 
 		 466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.98 
 
 		 515 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 		 537 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  27.68 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.37 
 
 		 579 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 		 514 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.09 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.52 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.91 
 
 		 520 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  30.02 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 		 515 aa  173  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 480 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  29.78 
 
 		 480 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 480 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.78 
 
 		 480 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.74 
 
 		 521 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 		 534 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 578 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 532 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 529 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 		 558 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 480 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 		 529 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  28.43 
 
 		 561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.53 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.9 
 
 		 507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.88 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.21 
 
 		 493 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.53 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.44 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.78 
 
 		 476 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.93 
 
 		 503 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.36 
 
 		 517 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.98 
 
 		 520 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
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NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 520 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.32 
 
 		 511 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 520 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 530 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.93 
 
 		 510 aa  163  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 520 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.52 
 
 		 529 aa  163  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 521 aa  163  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.46 
 
 		 477 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 520 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 520 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.27 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
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NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  27.91 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.95 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.64 
 
 		 529 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.82 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 545 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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