144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4195 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  94.1 
 
 		 407 aa  716    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  94.1 
 
 		 407 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 407 aa  829    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  58.15 
 
 		 400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  59.42 
 
 		 410 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  58.18 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  54.52 
 
 		 409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  54.57 
 
 		 402 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  35.84 
 
 		 386 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  35.33 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  49.25 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  37.7 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  44.55 
 
 		 380 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  41.27 
 
 		 492 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  42.6 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  42.6 
 
 		 380 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  45.19 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  41.45 
 
 		 405 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  36.92 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  35.04 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  38.83 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  31.88 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  39.23 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  37.86 
 
 		 373 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  37.68 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  37.04 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  38.95 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  37.63 
 
 		 372 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  27.43 
 
 		 391 aa  122  9e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  35.65 
 
 		 445 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  33.83 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  35.1 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  34.38 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  32.7 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 403 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 417 aa  106  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  34.38 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  31.43 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  36.55 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  34.41 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  28.95 
 
 		 369 aa  96.3  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  34.81 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  31.63 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  30.65 
 
 		 459 aa  86.7  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0020  conjugation TrbI-like protein  32.17 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  31.94 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  31.07 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  30.6 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  30.05 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  29.86 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  32.46 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  30.56 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  22.67 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  26.77 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  28.63 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  29.17 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  26.77 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  31.05 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  28.52 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  28.89 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  26.88 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  29.79 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  29.57 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  29.51 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  29.51 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  25.99 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  29.57 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  28.12 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  32.77 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  27.68 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  25.09 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  30.42 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  29.38 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  27.45 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  26.46 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  30.34 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  27.08 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  28.05 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  27.78 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  29.5 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  27.98 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  29.85 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  30.52 
 
 		 427 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  28.42 
 
 		 400 aa  67  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  27.69 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  28.4 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  26.6 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  26.55 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  26.34 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  28.73 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  27.08 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  27.08 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  26.55 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  30.37 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  26.55 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  30.37 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  28.51 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>