185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_0009 on replicon NC_011775
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  100 
 
 
60 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0890  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  48.28 
 
 
67 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  44.83 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  44.07 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  44.07 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  44.07 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  44.07 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  44.07 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  44.07 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1009  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  38.6 
 
 
383 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  44.83 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
187 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0059  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
61 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 
72 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0086  hipB protein, putative  37.5 
 
 
61 aa  47  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.288329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
107 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 
213 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 
143 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  42.37 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 
61 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  39.66 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0972  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
228 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.385835 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  40.35 
 
 
207 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  41.38 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0176  hypothetical protein  35.85 
 
 
239 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  43.33 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  41.38 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  43.33 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
208 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  40.35 
 
 
264 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  36.84 
 
 
181 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  42.37 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  41.38 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  42.37 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  42.37 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 
201 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  42.37 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 
213 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  39.66 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2282  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  39.66 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  46.67 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1906  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  39.66 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0810  transcriptional regulator  42.11 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0185254  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4356  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.623586  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2717  hypothetical protein  35.09 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2461  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000100603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0189  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0190  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995138  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3143  DNA-binding protein  39.66 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0283906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3390  DNA-binding protein  39.66 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.298234 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>