87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0086 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0086  hipB protein, putative  100 
 
 		 61 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.288329  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0059  XRE family transcriptional regulator  93.44 
 
 		 61 aa  120  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0162  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1009  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  37.5 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  42.86 
 
 		 509 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0556  hypothetical protein  47.92 
 
 		 49 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057041 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4356  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.623586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 224 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1998  hypothetical protein  51.35 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2717  hypothetical protein  40.68 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 85 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 105 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  42.5 
 
 		 94 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 201 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 83 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  51.28 
 
 		 92 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0240  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000370797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0029  helix-turn-helix domain-containing protein  47.06 
 
 		 855 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 915 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3130  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.78 
 
 		 517 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  38.18 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 213 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  46.67 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  40.38 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15930  predicted transcriptional regulator  33.9 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000543618  hitchhiker  0.000000237472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  43.14 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 256 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0989  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.214292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  37.74 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1128  Cro/CI family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000913081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0118  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3365  DNA-binding protein  31.03 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2234  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3863  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40.91 
 
 		 507 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.640494  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 116 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  42 
 
 		 225 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>