223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2234 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2234  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 86 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0162  XRE family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  44.3 
 
 		 490 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 211 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  42.03 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 516 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 211 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  42.35 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  51.85 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  44.64 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.37 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  40.62 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  40.62 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  40.62 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 371 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0551  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 198 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5338  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 503 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 230 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5594  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 490 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5414  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  37.7 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  41.94 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 402 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  39.13 
 
 		 270 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 488 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2292  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 504 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.89 
 
 		 481 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  40.54 
 
 		 489 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 203 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0059  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_002936  DET0086  hipB protein, putative  38.18 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.288329  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 200 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 183 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 223 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0506  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 642 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  37.29 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 		 478 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 403 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  37.74 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>